Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUJ5

4930524J08Rik, RIKEN cDNA 4930524J08 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930524J08RikQ9CUJ5 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
4930524J08RikQ9CUJ5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
4930524J08RikQ9CUJ5 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
4930524J08RikQ9CUJ5 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
4930524J08RikQ9CUJ5 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
4930524J08RikQ9CUJ5 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
4930524J08RikQ9CUJ5 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
4930524J08RikQ9CUJ5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
4930524J08RikQ9CUJ5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
4930524J08RikQ9CUJ5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
4930524J08RikQ9CUJ5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
4930524J08RikQ9CUJ5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
4930524J08RikQ9CUJ5 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
4930524J08RikQ9CUJ5 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
4930524J08RikQ9CUJ5 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
4930524J08RikQ9CUJ5 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
4930524J08RikQ9CUJ5 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
4930524J08RikQ9CUJ5 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
4930524J08RikQ9CUJ5 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
4930524J08RikQ9CUJ5 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
4930524J08RikQ9CUJ5 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
4930524J08RikQ9CUJ5 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
4930524J08RikQ9CUJ5 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
4930524J08RikQ9CUJ5 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
4930524J08RikQ9CUJ5 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
4930524J08RikQ9CUJ5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
4930524J08RikQ9CUJ5 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
4930524J08RikQ9CUJ5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
4930524J08RikQ9CUJ5 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
4930524J08RikQ9CUJ5 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
4930524J08RikQ9CUJ5 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
4930524J08RikQ9CUJ5 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
4930524J08RikQ9CUJ5 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
4930524J08RikQ9CUJ5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
4930524J08RikQ9CUJ5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
4930524J08RikQ9CUJ5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
4930524J08RikQ9CUJ5 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
4930524J08RikQ9CUJ5 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
4930524J08RikQ9CUJ5 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
4930524J08RikQ9CUJ5 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
4930524J08RikQ9CUJ5 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
4930524J08RikQ9CUJ5 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
4930524J08RikQ9CUJ5 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
4930524J08RikQ9CUJ5 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
4930524J08RikQ9CUJ5 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
4930524J08RikQ9CUJ5 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
4930524J08RikQ9CUJ5 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
4930524J08RikQ9CUJ5 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
4930524J08RikQ9CUJ5 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
4930524J08RikQ9CUJ5 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
4930524J08RikQ9CUJ5 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
4930524J08RikQ9CUJ5 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
4930524J08RikQ9CUJ5 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
4930524J08RikQ9CUJ5 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
4930524J08RikQ9CUJ5 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
4930524J08RikQ9CUJ5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
4930524J08RikQ9CUJ5 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
4930524J08RikQ9CUJ5 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
4930524J08RikQ9CUJ5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
4930524J08RikQ9CUJ5 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
4930524J08RikQ9CUJ5 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
4930524J08RikQ9CUJ5 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
4930524J08RikQ9CUJ5 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
4930524J08RikQ9CUJ5 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
4930524J08RikQ9CUJ5 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
4930524J08RikQ9CUJ5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
4930524J08RikQ9CUJ5 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
4930524J08RikQ9CUJ5 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
4930524J08RikQ9CUJ5 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
4930524J08RikQ9CUJ5 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
4930524J08RikQ9CUJ5 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
4930524J08RikQ9CUJ5 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
4930524J08RikQ9CUJ5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
4930524J08RikQ9CUJ5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
4930524J08RikQ9CUJ5 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
4930524J08RikQ9CUJ5 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
4930524J08RikQ9CUJ5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
4930524J08RikQ9CUJ5 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
4930524J08RikQ9CUJ5 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
4930524J08RikQ9CUJ5 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
4930524J08RikQ9CUJ5 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
4930524J08RikQ9CUJ5 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930524J08RikQ9CUJ5 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930524J08RikQ9CUJ5 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930524J08RikQ9CUJ5 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930524J08RikQ9CUJ5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930524J08RikQ9CUJ5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930524J08RikQ9CUJ5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930524J08RikQ9CUJ5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930524J08RikQ9CUJ5 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930524J08RikQ9CUJ5 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930524J08RikQ9CUJ5 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms