Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRA7

Atp5s, ATP synthase subunit s, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5sQ9CRA7 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp5sQ9CRA7 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp5sQ9CRA7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp5sQ9CRA7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp5sQ9CRA7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp5sQ9CRA7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp5sQ9CRA7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp5sQ9CRA7 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp5sQ9CRA7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp5sQ9CRA7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp5sQ9CRA7 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp5sQ9CRA7 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp5sQ9CRA7 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atp5sQ9CRA7 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atp5sQ9CRA7 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atp5sQ9CRA7 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atp5sQ9CRA7 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp5sQ9CRA7 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp5sQ9CRA7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp5sQ9CRA7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp5sQ9CRA7 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp5sQ9CRA7 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp5sQ9CRA7 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp5sQ9CRA7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp5sQ9CRA7 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp5sQ9CRA7 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp5sQ9CRA7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp5sQ9CRA7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp5sQ9CRA7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp5sQ9CRA7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp5sQ9CRA7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp5sQ9CRA7 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp5sQ9CRA7 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp5sQ9CRA7 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp5sQ9CRA7 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp5sQ9CRA7 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp5sQ9CRA7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp5sQ9CRA7 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp5sQ9CRA7 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp5sQ9CRA7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp5sQ9CRA7 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp5sQ9CRA7 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp5sQ9CRA7 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp5sQ9CRA7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp5sQ9CRA7 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp5sQ9CRA7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp5sQ9CRA7 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp5sQ9CRA7 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp5sQ9CRA7 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp5sQ9CRA7 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp5sQ9CRA7 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp5sQ9CRA7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp5sQ9CRA7 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp5sQ9CRA7 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp5sQ9CRA7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp5sQ9CRA7 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp5sQ9CRA7 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp5sQ9CRA7 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp5sQ9CRA7 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp5sQ9CRA7 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp5sQ9CRA7 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp5sQ9CRA7 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp5sQ9CRA7 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp5sQ9CRA7 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp5sQ9CRA7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp5sQ9CRA7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp5sQ9CRA7 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp5sQ9CRA7 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp5sQ9CRA7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp5sQ9CRA7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp5sQ9CRA7 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp5sQ9CRA7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp5sQ9CRA7 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp5sQ9CRA7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp5sQ9CRA7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp5sQ9CRA7 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp5sQ9CRA7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp5sQ9CRA7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp5sQ9CRA7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp5sQ9CRA7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp5sQ9CRA7 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp5sQ9CRA7 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp5sQ9CRA7 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp5sQ9CRA7 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp5sQ9CRA7 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp5sQ9CRA7 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp5sQ9CRA7 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp5sQ9CRA7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp5sQ9CRA7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp5sQ9CRA7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp5sQ9CRA7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp5sQ9CRA7 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atp5sQ9CRA7 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atp5sQ9CRA7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atp5sQ9CRA7 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atp5sQ9CRA7 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atp5sQ9CRA7 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Atp5sQ9CRA7 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp5sQ9CRA7 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp5sQ9CRA7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms