Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP3

Chchd5, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd5Q9CQP3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chchd5Q9CQP3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Chchd5Q9CQP3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Chchd5Q9CQP3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Chchd5Q9CQP3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Chchd5Q9CQP3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Chchd5Q9CQP3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Chchd5Q9CQP3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Chchd5Q9CQP3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Chchd5Q9CQP3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Chchd5Q9CQP3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Chchd5Q9CQP3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Chchd5Q9CQP3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Chchd5Q9CQP3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Chchd5Q9CQP3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Chchd5Q9CQP3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Chchd5Q9CQP3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Chchd5Q9CQP3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Chchd5Q9CQP3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Chchd5Q9CQP3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Chchd5Q9CQP3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Chchd5Q9CQP3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Chchd5Q9CQP3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Chchd5Q9CQP3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Chchd5Q9CQP3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Chchd5Q9CQP3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Chchd5Q9CQP3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Chchd5Q9CQP3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Chchd5Q9CQP3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Chchd5Q9CQP3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Chchd5Q9CQP3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Chchd5Q9CQP3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Chchd5Q9CQP3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Chchd5Q9CQP3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Chchd5Q9CQP3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Chchd5Q9CQP3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Chchd5Q9CQP3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Chchd5Q9CQP3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Chchd5Q9CQP3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Chchd5Q9CQP3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Chchd5Q9CQP3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Chchd5Q9CQP3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Chchd5Q9CQP3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Chchd5Q9CQP3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Chchd5Q9CQP3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Chchd5Q9CQP3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Chchd5Q9CQP3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Chchd5Q9CQP3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Chchd5Q9CQP3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Chchd5Q9CQP3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Chchd5Q9CQP3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Chchd5Q9CQP3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Chchd5Q9CQP3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Chchd5Q9CQP3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Chchd5Q9CQP3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Chchd5Q9CQP3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Chchd5Q9CQP3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Chchd5Q9CQP3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Chchd5Q9CQP3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Chchd5Q9CQP3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Chchd5Q9CQP3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Chchd5Q9CQP3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Chchd5Q9CQP3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Chchd5Q9CQP3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Chchd5Q9CQP3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Chchd5Q9CQP3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Chchd5Q9CQP3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Chchd5Q9CQP3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Chchd5Q9CQP3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Chchd5Q9CQP3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Chchd5Q9CQP3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Chchd5Q9CQP3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Chchd5Q9CQP3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Chchd5Q9CQP3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Chchd5Q9CQP3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Chchd5Q9CQP3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Chchd5Q9CQP3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Chchd5Q9CQP3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Chchd5Q9CQP3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Chchd5Q9CQP3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Chchd5Q9CQP3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Chchd5Q9CQP3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Chchd5Q9CQP3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Chchd5Q9CQP3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Chchd5Q9CQP3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Chchd5Q9CQP3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Chchd5Q9CQP3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Chchd5Q9CQP3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Chchd5Q9CQP3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Chchd5Q9CQP3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Chchd5Q9CQP3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Chchd5Q9CQP3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Chchd5Q9CQP3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Chchd5Q9CQP3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Chchd5Q9CQP3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Chchd5Q9CQP3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Chchd5Q9CQP3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Chchd5Q9CQP3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Chchd5Q9CQP3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Chchd5Q9CQP3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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