Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab5aQ9CQD1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab5aQ9CQD1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab5aQ9CQD1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab5aQ9CQD1 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab5aQ9CQD1 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab5aQ9CQD1 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab5aQ9CQD1 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab5aQ9CQD1 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab5aQ9CQD1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab5aQ9CQD1 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab5aQ9CQD1 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab5aQ9CQD1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab5aQ9CQD1 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab5aQ9CQD1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab5aQ9CQD1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab5aQ9CQD1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab5aQ9CQD1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab5aQ9CQD1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab5aQ9CQD1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab5aQ9CQD1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab5aQ9CQD1 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab5aQ9CQD1 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab5aQ9CQD1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab5aQ9CQD1 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab5aQ9CQD1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab5aQ9CQD1 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab5aQ9CQD1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab5aQ9CQD1 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab5aQ9CQD1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab5aQ9CQD1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab5aQ9CQD1 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab5aQ9CQD1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab5aQ9CQD1 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab5aQ9CQD1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab5aQ9CQD1 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab5aQ9CQD1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab5aQ9CQD1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab5aQ9CQD1 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab5aQ9CQD1 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab5aQ9CQD1 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab5aQ9CQD1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab5aQ9CQD1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab5aQ9CQD1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab5aQ9CQD1 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab5aQ9CQD1 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab5aQ9CQD1 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab5aQ9CQD1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab5aQ9CQD1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab5aQ9CQD1 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab5aQ9CQD1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab5aQ9CQD1 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab5aQ9CQD1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab5aQ9CQD1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab5aQ9CQD1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab5aQ9CQD1 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab5aQ9CQD1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab5aQ9CQD1 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab5aQ9CQD1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab5aQ9CQD1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab5aQ9CQD1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab5aQ9CQD1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab5aQ9CQD1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab5aQ9CQD1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab5aQ9CQD1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab5aQ9CQD1 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab5aQ9CQD1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab5aQ9CQD1 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab5aQ9CQD1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab5aQ9CQD1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab5aQ9CQD1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab5aQ9CQD1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab5aQ9CQD1 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab5aQ9CQD1 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab5aQ9CQD1 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab5aQ9CQD1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab5aQ9CQD1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab5aQ9CQD1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab5aQ9CQD1 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab5aQ9CQD1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab5aQ9CQD1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab5aQ9CQD1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab5aQ9CQD1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab5aQ9CQD1 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab5aQ9CQD1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab5aQ9CQD1 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab5aQ9CQD1 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab5aQ9CQD1 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab5aQ9CQD1 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab5aQ9CQD1 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab5aQ9CQD1 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab5aQ9CQD1 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab5aQ9CQD1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab5aQ9CQD1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab5aQ9CQD1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab5aQ9CQD1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab5aQ9CQD1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab5aQ9CQD1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab5aQ9CQD1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab5aQ9CQD1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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