Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Commd4Q9CQ02 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Commd4Q9CQ02 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Commd4Q9CQ02 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Commd4Q9CQ02 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Commd4Q9CQ02 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Commd4Q9CQ02 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Commd4Q9CQ02 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Commd4Q9CQ02 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Commd4Q9CQ02 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Commd4Q9CQ02 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Commd4Q9CQ02 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Commd4Q9CQ02 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Commd4Q9CQ02 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Commd4Q9CQ02 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Commd4Q9CQ02 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Commd4Q9CQ02 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Commd4Q9CQ02 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Commd4Q9CQ02 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Commd4Q9CQ02 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Commd4Q9CQ02 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Commd4Q9CQ02 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Commd4Q9CQ02 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Commd4Q9CQ02 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Commd4Q9CQ02 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Commd4Q9CQ02 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Commd4Q9CQ02 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Commd4Q9CQ02 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Commd4Q9CQ02 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Commd4Q9CQ02 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Commd4Q9CQ02 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Commd4Q9CQ02 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Commd4Q9CQ02 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Commd4Q9CQ02 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Commd4Q9CQ02 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Commd4Q9CQ02 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Commd4Q9CQ02 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Commd4Q9CQ02 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Commd4Q9CQ02 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Commd4Q9CQ02 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Commd4Q9CQ02 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Commd4Q9CQ02 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Commd4Q9CQ02 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Commd4Q9CQ02 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Commd4Q9CQ02 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Commd4Q9CQ02 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Commd4Q9CQ02 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Commd4Q9CQ02 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Commd4Q9CQ02 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Commd4Q9CQ02 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Commd4Q9CQ02 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Commd4Q9CQ02 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Commd4Q9CQ02 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Commd4Q9CQ02 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Commd4Q9CQ02 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Commd4Q9CQ02 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Commd4Q9CQ02 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Commd4Q9CQ02 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Commd4Q9CQ02 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Commd4Q9CQ02 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Commd4Q9CQ02 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Commd4Q9CQ02 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Commd4Q9CQ02 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Commd4Q9CQ02 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Commd4Q9CQ02 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Commd4Q9CQ02 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Commd4Q9CQ02 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Commd4Q9CQ02 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Commd4Q9CQ02 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Commd4Q9CQ02 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Commd4Q9CQ02 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Commd4Q9CQ02 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Commd4Q9CQ02 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Commd4Q9CQ02 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Commd4Q9CQ02 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Commd4Q9CQ02 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Commd4Q9CQ02 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Commd4Q9CQ02 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Commd4Q9CQ02 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Commd4Q9CQ02 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Commd4Q9CQ02 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Commd4Q9CQ02 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Commd4Q9CQ02 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Commd4Q9CQ02 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Commd4Q9CQ02 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Commd4Q9CQ02 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Commd4Q9CQ02 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Commd4Q9CQ02 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Commd4Q9CQ02 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Commd4Q9CQ02 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Commd4Q9CQ02 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Commd4Q9CQ02 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Commd4Q9CQ02 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Commd4Q9CQ02 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Commd4Q9CQ02 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Commd4Q9CQ02 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Commd4Q9CQ02 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Commd4Q9CQ02 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Commd4Q9CQ02 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Commd4Q9CQ02 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms