Protein–RNA interactions for Protein: Q99504

EYA3, Eyes absent homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EYA3Q99504 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
EYA3Q99504 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
EYA3Q99504 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
EYA3Q99504 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EYA3Q99504 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EYA3Q99504 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
EYA3Q99504 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
EYA3Q99504 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
EYA3Q99504 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EYA3Q99504 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
EYA3Q99504 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EYA3Q99504 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EYA3Q99504 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EYA3Q99504 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EYA3Q99504 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
EYA3Q99504 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
EYA3Q99504 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
EYA3Q99504 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
EYA3Q99504 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
EYA3Q99504 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
EYA3Q99504 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
EYA3Q99504 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
EYA3Q99504 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
EYA3Q99504 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
EYA3Q99504 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
EYA3Q99504 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
EYA3Q99504 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
EYA3Q99504 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
EYA3Q99504 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
EYA3Q99504 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
EYA3Q99504 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
EYA3Q99504 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
EYA3Q99504 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
EYA3Q99504 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
EYA3Q99504 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
EYA3Q99504 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
EYA3Q99504 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
EYA3Q99504 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
EYA3Q99504 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
EYA3Q99504 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
EYA3Q99504 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
EYA3Q99504 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
EYA3Q99504 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
EYA3Q99504 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
EYA3Q99504 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
EYA3Q99504 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
EYA3Q99504 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
EYA3Q99504 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
EYA3Q99504 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
EYA3Q99504 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
EYA3Q99504 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
EYA3Q99504 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
EYA3Q99504 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
EYA3Q99504 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
EYA3Q99504 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
EYA3Q99504 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
EYA3Q99504 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
EYA3Q99504 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
EYA3Q99504 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
EYA3Q99504 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
EYA3Q99504 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
EYA3Q99504 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
EYA3Q99504 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
EYA3Q99504 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
EYA3Q99504 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
EYA3Q99504 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
EYA3Q99504 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
EYA3Q99504 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
EYA3Q99504 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
EYA3Q99504 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
EYA3Q99504 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
EYA3Q99504 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
EYA3Q99504 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
EYA3Q99504 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
EYA3Q99504 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
EYA3Q99504 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
EYA3Q99504 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
EYA3Q99504 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
EYA3Q99504 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
EYA3Q99504 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
EYA3Q99504 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
EYA3Q99504 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
EYA3Q99504 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
EYA3Q99504 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
EYA3Q99504 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
EYA3Q99504 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
EYA3Q99504 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
EYA3Q99504 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
EYA3Q99504 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
EYA3Q99504 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
EYA3Q99504 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
EYA3Q99504 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
EYA3Q99504 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
EYA3Q99504 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
EYA3Q99504 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
EYA3Q99504 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
EYA3Q99504 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
EYA3Q99504 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
EYA3Q99504 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
EYA3Q99504 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms