Protein–RNA interactions for Protein: Q96IT1

ZNF496, Zinc finger protein 496, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF496Q96IT1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ZNF496Q96IT1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ZNF496Q96IT1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ZNF496Q96IT1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ZNF496Q96IT1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ZNF496Q96IT1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ZNF496Q96IT1 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ZNF496Q96IT1 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ZNF496Q96IT1 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ZNF496Q96IT1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ZNF496Q96IT1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ZNF496Q96IT1 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ZNF496Q96IT1 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ZNF496Q96IT1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ZNF496Q96IT1 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ZNF496Q96IT1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ZNF496Q96IT1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ZNF496Q96IT1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ZNF496Q96IT1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ZNF496Q96IT1 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ZNF496Q96IT1 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
ZNF496Q96IT1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ZNF496Q96IT1 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
ZNF496Q96IT1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ZNF496Q96IT1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ZNF496Q96IT1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ZNF496Q96IT1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ZNF496Q96IT1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
ZNF496Q96IT1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ZNF496Q96IT1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ZNF496Q96IT1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ZNF496Q96IT1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ZNF496Q96IT1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ZNF496Q96IT1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ZNF496Q96IT1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ZNF496Q96IT1 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ZNF496Q96IT1 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ZNF496Q96IT1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ZNF496Q96IT1 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
ZNF496Q96IT1 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ZNF496Q96IT1 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
ZNF496Q96IT1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ZNF496Q96IT1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
ZNF496Q96IT1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ZNF496Q96IT1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ZNF496Q96IT1 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
ZNF496Q96IT1 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ZNF496Q96IT1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ZNF496Q96IT1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ZNF496Q96IT1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ZNF496Q96IT1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ZNF496Q96IT1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ZNF496Q96IT1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ZNF496Q96IT1 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ZNF496Q96IT1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ZNF496Q96IT1 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ZNF496Q96IT1 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ZNF496Q96IT1 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ZNF496Q96IT1 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
ZNF496Q96IT1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ZNF496Q96IT1 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ZNF496Q96IT1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ZNF496Q96IT1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZNF496Q96IT1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZNF496Q96IT1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZNF496Q96IT1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZNF496Q96IT1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
ZNF496Q96IT1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZNF496Q96IT1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZNF496Q96IT1 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZNF496Q96IT1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZNF496Q96IT1 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZNF496Q96IT1 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZNF496Q96IT1 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
ZNF496Q96IT1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZNF496Q96IT1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZNF496Q96IT1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ZNF496Q96IT1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ZNF496Q96IT1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ZNF496Q96IT1 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ZNF496Q96IT1 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ZNF496Q96IT1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ZNF496Q96IT1 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ZNF496Q96IT1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ZNF496Q96IT1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ZNF496Q96IT1 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ZNF496Q96IT1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ZNF496Q96IT1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZNF496Q96IT1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZNF496Q96IT1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZNF496Q96IT1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZNF496Q96IT1 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZNF496Q96IT1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZNF496Q96IT1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZNF496Q96IT1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZNF496Q96IT1 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZNF496Q96IT1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZNF496Q96IT1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
ZNF496Q96IT1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZNF496Q96IT1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms