Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4R6

Nup35, Nucleoporin NUP53, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup35Q8R4R6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup35Q8R4R6 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup35Q8R4R6 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup35Q8R4R6 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nup35Q8R4R6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup35Q8R4R6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup35Q8R4R6 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup35Q8R4R6 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup35Q8R4R6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup35Q8R4R6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup35Q8R4R6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup35Q8R4R6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup35Q8R4R6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup35Q8R4R6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup35Q8R4R6 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup35Q8R4R6 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup35Q8R4R6 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup35Q8R4R6 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup35Q8R4R6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup35Q8R4R6 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup35Q8R4R6 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nup35Q8R4R6 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup35Q8R4R6 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup35Q8R4R6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup35Q8R4R6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup35Q8R4R6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup35Q8R4R6 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup35Q8R4R6 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nup35Q8R4R6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup35Q8R4R6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup35Q8R4R6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup35Q8R4R6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup35Q8R4R6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup35Q8R4R6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup35Q8R4R6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup35Q8R4R6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup35Q8R4R6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup35Q8R4R6 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup35Q8R4R6 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup35Q8R4R6 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup35Q8R4R6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nup35Q8R4R6 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup35Q8R4R6 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup35Q8R4R6 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup35Q8R4R6 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup35Q8R4R6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup35Q8R4R6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup35Q8R4R6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup35Q8R4R6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup35Q8R4R6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup35Q8R4R6 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup35Q8R4R6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup35Q8R4R6 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nup35Q8R4R6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup35Q8R4R6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup35Q8R4R6 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup35Q8R4R6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup35Q8R4R6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup35Q8R4R6 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup35Q8R4R6 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup35Q8R4R6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup35Q8R4R6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup35Q8R4R6 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup35Q8R4R6 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup35Q8R4R6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup35Q8R4R6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup35Q8R4R6 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup35Q8R4R6 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nup35Q8R4R6 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nup35Q8R4R6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nup35Q8R4R6 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nup35Q8R4R6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nup35Q8R4R6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nup35Q8R4R6 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nup35Q8R4R6 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nup35Q8R4R6 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup35Q8R4R6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup35Q8R4R6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup35Q8R4R6 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup35Q8R4R6 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup35Q8R4R6 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup35Q8R4R6 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup35Q8R4R6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup35Q8R4R6 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nup35Q8R4R6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nup35Q8R4R6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nup35Q8R4R6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nup35Q8R4R6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16■□□□□ 0.15
Nup35Q8R4R6 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nup35Q8R4R6 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nup35Q8R4R6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nup35Q8R4R6 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nup35Q8R4R6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nup35Q8R4R6 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup35Q8R4R6 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup35Q8R4R6 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup35Q8R4R6 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup35Q8R4R6 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup35Q8R4R6 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup35Q8R4R6 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms