Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2H2

Otud6b, OTU domain-containing protein 6B, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud6bQ8K2H2 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Otud6bQ8K2H2 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Otud6bQ8K2H2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Otud6bQ8K2H2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Otud6bQ8K2H2 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Otud6bQ8K2H2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Otud6bQ8K2H2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Otud6bQ8K2H2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Otud6bQ8K2H2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Otud6bQ8K2H2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Otud6bQ8K2H2 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Otud6bQ8K2H2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Otud6bQ8K2H2 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Otud6bQ8K2H2 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Otud6bQ8K2H2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Otud6bQ8K2H2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Otud6bQ8K2H2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Otud6bQ8K2H2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Otud6bQ8K2H2 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Otud6bQ8K2H2 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Otud6bQ8K2H2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Otud6bQ8K2H2 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Otud6bQ8K2H2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Otud6bQ8K2H2 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Otud6bQ8K2H2 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Otud6bQ8K2H2 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Otud6bQ8K2H2 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Otud6bQ8K2H2 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Otud6bQ8K2H2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Otud6bQ8K2H2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Otud6bQ8K2H2 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Otud6bQ8K2H2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Otud6bQ8K2H2 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Otud6bQ8K2H2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Otud6bQ8K2H2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Otud6bQ8K2H2 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Otud6bQ8K2H2 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Otud6bQ8K2H2 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Otud6bQ8K2H2 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Otud6bQ8K2H2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Otud6bQ8K2H2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Otud6bQ8K2H2 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Otud6bQ8K2H2 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Otud6bQ8K2H2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Otud6bQ8K2H2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Otud6bQ8K2H2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Otud6bQ8K2H2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Otud6bQ8K2H2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Otud6bQ8K2H2 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Otud6bQ8K2H2 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Otud6bQ8K2H2 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Otud6bQ8K2H2 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Otud6bQ8K2H2 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Otud6bQ8K2H2 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Otud6bQ8K2H2 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Otud6bQ8K2H2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Otud6bQ8K2H2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Otud6bQ8K2H2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Otud6bQ8K2H2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Otud6bQ8K2H2 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Otud6bQ8K2H2 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Otud6bQ8K2H2 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Otud6bQ8K2H2 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Otud6bQ8K2H2 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Otud6bQ8K2H2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Otud6bQ8K2H2 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Otud6bQ8K2H2 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Otud6bQ8K2H2 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Otud6bQ8K2H2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Otud6bQ8K2H2 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Otud6bQ8K2H2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Otud6bQ8K2H2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Otud6bQ8K2H2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Otud6bQ8K2H2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Otud6bQ8K2H2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Otud6bQ8K2H2 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Otud6bQ8K2H2 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Otud6bQ8K2H2 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Otud6bQ8K2H2 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Otud6bQ8K2H2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Otud6bQ8K2H2 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Otud6bQ8K2H2 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Otud6bQ8K2H2 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Otud6bQ8K2H2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Otud6bQ8K2H2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Otud6bQ8K2H2 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Otud6bQ8K2H2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Otud6bQ8K2H2 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Otud6bQ8K2H2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Otud6bQ8K2H2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Otud6bQ8K2H2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Otud6bQ8K2H2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Otud6bQ8K2H2 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Otud6bQ8K2H2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Otud6bQ8K2H2 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Otud6bQ8K2H2 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Otud6bQ8K2H2 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Otud6bQ8K2H2 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Otud6bQ8K2H2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Otud6bQ8K2H2 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms