Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Abcf3Q8K268 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Abcf3Q8K268 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Abcf3Q8K268 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Abcf3Q8K268 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Abcf3Q8K268 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Abcf3Q8K268 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Abcf3Q8K268 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Abcf3Q8K268 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Abcf3Q8K268 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Abcf3Q8K268 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Abcf3Q8K268 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Abcf3Q8K268 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Abcf3Q8K268 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Abcf3Q8K268 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Abcf3Q8K268 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Abcf3Q8K268 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Abcf3Q8K268 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Abcf3Q8K268 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Abcf3Q8K268 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Abcf3Q8K268 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Abcf3Q8K268 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Abcf3Q8K268 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Abcf3Q8K268 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Abcf3Q8K268 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Abcf3Q8K268 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Abcf3Q8K268 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Abcf3Q8K268 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Abcf3Q8K268 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Abcf3Q8K268 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Abcf3Q8K268 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Abcf3Q8K268 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Abcf3Q8K268 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Abcf3Q8K268 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Abcf3Q8K268 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Abcf3Q8K268 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Abcf3Q8K268 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Abcf3Q8K268 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Abcf3Q8K268 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Abcf3Q8K268 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Abcf3Q8K268 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Abcf3Q8K268 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Abcf3Q8K268 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Abcf3Q8K268 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Abcf3Q8K268 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Abcf3Q8K268 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Abcf3Q8K268 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Abcf3Q8K268 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Abcf3Q8K268 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Abcf3Q8K268 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Abcf3Q8K268 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Abcf3Q8K268 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Abcf3Q8K268 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Abcf3Q8K268 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Abcf3Q8K268 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Abcf3Q8K268 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Abcf3Q8K268 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Abcf3Q8K268 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Abcf3Q8K268 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Abcf3Q8K268 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Abcf3Q8K268 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Abcf3Q8K268 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Abcf3Q8K268 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Abcf3Q8K268 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Abcf3Q8K268 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Abcf3Q8K268 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Abcf3Q8K268 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Abcf3Q8K268 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Abcf3Q8K268 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Abcf3Q8K268 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Abcf3Q8K268 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Abcf3Q8K268 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Abcf3Q8K268 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Abcf3Q8K268 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Abcf3Q8K268 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Abcf3Q8K268 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Abcf3Q8K268 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Abcf3Q8K268 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Abcf3Q8K268 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Abcf3Q8K268 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Abcf3Q8K268 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Abcf3Q8K268 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Abcf3Q8K268 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Abcf3Q8K268 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Abcf3Q8K268 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Abcf3Q8K268 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Abcf3Q8K268 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Abcf3Q8K268 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Abcf3Q8K268 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Abcf3Q8K268 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Abcf3Q8K268 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Abcf3Q8K268 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Abcf3Q8K268 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Abcf3Q8K268 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Abcf3Q8K268 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Abcf3Q8K268 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Abcf3Q8K268 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Abcf3Q8K268 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Abcf3Q8K268 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Abcf3Q8K268 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms