Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHZ9

Mterf1a, Transcription termination factor 1a, mitochondrial, mousemouse

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf1aQ8CHZ9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mterf1aQ8CHZ9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mterf1aQ8CHZ9 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mterf1aQ8CHZ9 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mterf1aQ8CHZ9 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mterf1aQ8CHZ9 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mterf1aQ8CHZ9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mterf1aQ8CHZ9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Mterf1aQ8CHZ9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mterf1aQ8CHZ9 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mterf1aQ8CHZ9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mterf1aQ8CHZ9 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mterf1aQ8CHZ9 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mterf1aQ8CHZ9 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mterf1aQ8CHZ9 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mterf1aQ8CHZ9 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mterf1aQ8CHZ9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mterf1aQ8CHZ9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mterf1aQ8CHZ9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mterf1aQ8CHZ9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mterf1aQ8CHZ9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Mterf1aQ8CHZ9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mterf1aQ8CHZ9 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Mterf1aQ8CHZ9 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Mterf1aQ8CHZ9 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Mterf1aQ8CHZ9 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Mterf1aQ8CHZ9 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mterf1aQ8CHZ9 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mterf1aQ8CHZ9 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mterf1aQ8CHZ9 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mterf1aQ8CHZ9 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mterf1aQ8CHZ9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mterf1aQ8CHZ9 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mterf1aQ8CHZ9 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mterf1aQ8CHZ9 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mterf1aQ8CHZ9 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mterf1aQ8CHZ9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mterf1aQ8CHZ9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mterf1aQ8CHZ9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mterf1aQ8CHZ9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mterf1aQ8CHZ9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mterf1aQ8CHZ9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mterf1aQ8CHZ9 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mterf1aQ8CHZ9 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mterf1aQ8CHZ9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mterf1aQ8CHZ9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mterf1aQ8CHZ9 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mterf1aQ8CHZ9 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mterf1aQ8CHZ9 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mterf1aQ8CHZ9 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mterf1aQ8CHZ9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mterf1aQ8CHZ9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mterf1aQ8CHZ9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mterf1aQ8CHZ9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mterf1aQ8CHZ9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mterf1aQ8CHZ9 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mterf1aQ8CHZ9 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mterf1aQ8CHZ9 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mterf1aQ8CHZ9 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mterf1aQ8CHZ9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mterf1aQ8CHZ9 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mterf1aQ8CHZ9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mterf1aQ8CHZ9 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mterf1aQ8CHZ9 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mterf1aQ8CHZ9 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mterf1aQ8CHZ9 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mterf1aQ8CHZ9 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Mterf1aQ8CHZ9 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mterf1aQ8CHZ9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mterf1aQ8CHZ9 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mterf1aQ8CHZ9 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mterf1aQ8CHZ9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mterf1aQ8CHZ9 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mterf1aQ8CHZ9 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mterf1aQ8CHZ9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mterf1aQ8CHZ9 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mterf1aQ8CHZ9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mterf1aQ8CHZ9 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mterf1aQ8CHZ9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mterf1aQ8CHZ9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mterf1aQ8CHZ9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mterf1aQ8CHZ9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mterf1aQ8CHZ9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mterf1aQ8CHZ9 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mterf1aQ8CHZ9 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mterf1aQ8CHZ9 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mterf1aQ8CHZ9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mterf1aQ8CHZ9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mterf1aQ8CHZ9 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mterf1aQ8CHZ9 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mterf1aQ8CHZ9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mterf1aQ8CHZ9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mterf1aQ8CHZ9 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mterf1aQ8CHZ9 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mterf1aQ8CHZ9 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mterf1aQ8CHZ9 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mterf1aQ8CHZ9 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mterf1aQ8CHZ9 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mterf1aQ8CHZ9 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mterf1aQ8CHZ9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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