Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5C9

TPA-induced transmembrane protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C5C9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Q8C5C9 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q8C5C9 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q8C5C9 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q8C5C9 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q8C5C9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q8C5C9 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q8C5C9 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q8C5C9 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q8C5C9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q8C5C9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Q8C5C9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q8C5C9 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q8C5C9 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q8C5C9 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q8C5C9 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q8C5C9 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Q8C5C9 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q8C5C9 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q8C5C9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q8C5C9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q8C5C9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q8C5C9 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q8C5C9 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q8C5C9 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q8C5C9 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q8C5C9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q8C5C9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q8C5C9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Q8C5C9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q8C5C9 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q8C5C9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q8C5C9 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q8C5C9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q8C5C9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q8C5C9 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q8C5C9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q8C5C9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Q8C5C9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q8C5C9 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q8C5C9 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q8C5C9 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q8C5C9 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q8C5C9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Q8C5C9 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q8C5C9 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q8C5C9 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q8C5C9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q8C5C9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q8C5C9 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q8C5C9 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q8C5C9 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q8C5C9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q8C5C9 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q8C5C9 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Q8C5C9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q8C5C9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q8C5C9 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q8C5C9 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q8C5C9 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q8C5C9 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q8C5C9 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q8C5C9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q8C5C9 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q8C5C9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q8C5C9 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q8C5C9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q8C5C9 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q8C5C9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q8C5C9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q8C5C9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q8C5C9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q8C5C9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q8C5C9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q8C5C9 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q8C5C9 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q8C5C9 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q8C5C9 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q8C5C9 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q8C5C9 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Q8C5C9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Q8C5C9 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Q8C5C9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q8C5C9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q8C5C9 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q8C5C9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q8C5C9 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q8C5C9 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q8C5C9 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q8C5C9 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q8C5C9 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q8C5C9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q8C5C9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q8C5C9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q8C5C9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Q8C5C9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q8C5C9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Q8C5C9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q8C5C9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q8C5C9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms