Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIF2

Rbfox3, RNA binding protein fox-1 homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbfox3Q8BIF2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbfox3Q8BIF2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbfox3Q8BIF2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbfox3Q8BIF2 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbfox3Q8BIF2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbfox3Q8BIF2 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbfox3Q8BIF2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbfox3Q8BIF2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbfox3Q8BIF2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbfox3Q8BIF2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbfox3Q8BIF2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbfox3Q8BIF2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbfox3Q8BIF2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbfox3Q8BIF2 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbfox3Q8BIF2 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbfox3Q8BIF2 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbfox3Q8BIF2 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbfox3Q8BIF2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbfox3Q8BIF2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbfox3Q8BIF2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbfox3Q8BIF2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbfox3Q8BIF2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbfox3Q8BIF2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbfox3Q8BIF2 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbfox3Q8BIF2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbfox3Q8BIF2 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbfox3Q8BIF2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbfox3Q8BIF2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbfox3Q8BIF2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbfox3Q8BIF2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbfox3Q8BIF2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbfox3Q8BIF2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbfox3Q8BIF2 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbfox3Q8BIF2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbfox3Q8BIF2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbfox3Q8BIF2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbfox3Q8BIF2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbfox3Q8BIF2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbfox3Q8BIF2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbfox3Q8BIF2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbfox3Q8BIF2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbfox3Q8BIF2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbfox3Q8BIF2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbfox3Q8BIF2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbfox3Q8BIF2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbfox3Q8BIF2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbfox3Q8BIF2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbfox3Q8BIF2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbfox3Q8BIF2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbfox3Q8BIF2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbfox3Q8BIF2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbfox3Q8BIF2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbfox3Q8BIF2 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbfox3Q8BIF2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbfox3Q8BIF2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rbfox3Q8BIF2 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rbfox3Q8BIF2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Rbfox3Q8BIF2 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbfox3Q8BIF2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbfox3Q8BIF2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rbfox3Q8BIF2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbfox3Q8BIF2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Rbfox3Q8BIF2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rbfox3Q8BIF2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbfox3Q8BIF2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbfox3Q8BIF2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbfox3Q8BIF2 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rbfox3Q8BIF2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbfox3Q8BIF2 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rbfox3Q8BIF2 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rbfox3Q8BIF2 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbfox3Q8BIF2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbfox3Q8BIF2 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbfox3Q8BIF2 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbfox3Q8BIF2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rbfox3Q8BIF2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbfox3Q8BIF2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbfox3Q8BIF2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbfox3Q8BIF2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rbfox3Q8BIF2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbfox3Q8BIF2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rbfox3Q8BIF2 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbfox3Q8BIF2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rbfox3Q8BIF2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbfox3Q8BIF2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbfox3Q8BIF2 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rbfox3Q8BIF2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbfox3Q8BIF2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbfox3Q8BIF2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbfox3Q8BIF2 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbfox3Q8BIF2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbfox3Q8BIF2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rbfox3Q8BIF2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Rbfox3Q8BIF2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbfox3Q8BIF2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbfox3Q8BIF2 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rbfox3Q8BIF2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rbfox3Q8BIF2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Rbfox3Q8BIF2 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbfox3Q8BIF2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms