Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
NischQ80TM9 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
NischQ80TM9 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC42.1■■■■■ 4.33
NischQ80TM9 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
NischQ80TM9 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.09■■■■■ 4.33
NischQ80TM9 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC42.09■■■■■ 4.33
NischQ80TM9 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC42.09■■■■■ 4.33
NischQ80TM9 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
NischQ80TM9 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
NischQ80TM9 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC42.08■■■■■ 4.33
NischQ80TM9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
NischQ80TM9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
NischQ80TM9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
NischQ80TM9 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
NischQ80TM9 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
NischQ80TM9 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC42.06■■■■■ 4.32
NischQ80TM9 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
NischQ80TM9 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
NischQ80TM9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
NischQ80TM9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
NischQ80TM9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
NischQ80TM9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
NischQ80TM9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
NischQ80TM9 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC42.05■■■■■ 4.32
NischQ80TM9 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
NischQ80TM9 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC42.05■■■■■ 4.32
NischQ80TM9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
NischQ80TM9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
NischQ80TM9 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
NischQ80TM9 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
NischQ80TM9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.03■■■■■ 4.32
NischQ80TM9 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
NischQ80TM9 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC42.03■■■■■ 4.32
NischQ80TM9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
NischQ80TM9 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
NischQ80TM9 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
NischQ80TM9 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC42.01■■■■■ 4.32
NischQ80TM9 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC42.01■■■■■ 4.32
NischQ80TM9 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC42.01■■■■■ 4.32
NischQ80TM9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC42■■■■■ 4.31
NischQ80TM9 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC42■■■■■ 4.31
NischQ80TM9 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC42■■■■■ 4.31
NischQ80TM9 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
NischQ80TM9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC42■■■■■ 4.31
NischQ80TM9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
NischQ80TM9 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.99■■■■■ 4.31
NischQ80TM9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
NischQ80TM9 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC41.98■■■■■ 4.31
NischQ80TM9 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
NischQ80TM9 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
NischQ80TM9 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
NischQ80TM9 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
NischQ80TM9 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
NischQ80TM9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
NischQ80TM9 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC41.96■■■■■ 4.31
NischQ80TM9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC41.96■■■■■ 4.31
NischQ80TM9 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
NischQ80TM9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
NischQ80TM9 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
NischQ80TM9 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC41.95■■■■■ 4.31
NischQ80TM9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
NischQ80TM9 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC41.94■■■■■ 4.31
NischQ80TM9 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.31
NischQ80TM9 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
NischQ80TM9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
NischQ80TM9 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC41.93■■■■■ 4.3
NischQ80TM9 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
NischQ80TM9 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
NischQ80TM9 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC41.93■■■■■ 4.3
NischQ80TM9 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
NischQ80TM9 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC41.93■■■■■ 4.3
NischQ80TM9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC41.92■■■■■ 4.3
NischQ80TM9 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.92■■■■■ 4.3
NischQ80TM9 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
NischQ80TM9 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
NischQ80TM9 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.91■■■■■ 4.3
NischQ80TM9 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC41.9■■■■■ 4.3
NischQ80TM9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
NischQ80TM9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
NischQ80TM9 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
NischQ80TM9 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC41.89■■■■■ 4.3
NischQ80TM9 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC41.89■■■■■ 4.3
NischQ80TM9 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
NischQ80TM9 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC41.89■■■■■ 4.3
NischQ80TM9 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
NischQ80TM9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
NischQ80TM9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
NischQ80TM9 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.88■■■■■ 4.3
NischQ80TM9 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.3
NischQ80TM9 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.3
NischQ80TM9 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.29
NischQ80TM9 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.29
NischQ80TM9 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC41.88■■■■■ 4.29
NischQ80TM9 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC41.87■■■■■ 4.29
NischQ80TM9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC41.87■■■■■ 4.29
NischQ80TM9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
NischQ80TM9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
NischQ80TM9 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
NischQ80TM9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
NischQ80TM9 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
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