Protein–RNA interactions for Protein: Q80T74

Klhl29, Kelch-like protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 875 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl29Q80T74 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klhl29Q80T74 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klhl29Q80T74 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klhl29Q80T74 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klhl29Q80T74 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klhl29Q80T74 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klhl29Q80T74 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klhl29Q80T74 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klhl29Q80T74 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klhl29Q80T74 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klhl29Q80T74 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klhl29Q80T74 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klhl29Q80T74 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klhl29Q80T74 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klhl29Q80T74 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klhl29Q80T74 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klhl29Q80T74 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klhl29Q80T74 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klhl29Q80T74 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klhl29Q80T74 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klhl29Q80T74 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klhl29Q80T74 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klhl29Q80T74 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klhl29Q80T74 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klhl29Q80T74 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klhl29Q80T74 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klhl29Q80T74 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klhl29Q80T74 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klhl29Q80T74 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klhl29Q80T74 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klhl29Q80T74 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klhl29Q80T74 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klhl29Q80T74 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klhl29Q80T74 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klhl29Q80T74 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klhl29Q80T74 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klhl29Q80T74 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klhl29Q80T74 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klhl29Q80T74 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klhl29Q80T74 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klhl29Q80T74 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klhl29Q80T74 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klhl29Q80T74 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klhl29Q80T74 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Klhl29Q80T74 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Klhl29Q80T74 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Klhl29Q80T74 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klhl29Q80T74 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klhl29Q80T74 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klhl29Q80T74 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klhl29Q80T74 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klhl29Q80T74 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klhl29Q80T74 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klhl29Q80T74 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klhl29Q80T74 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klhl29Q80T74 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klhl29Q80T74 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klhl29Q80T74 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klhl29Q80T74 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klhl29Q80T74 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klhl29Q80T74 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klhl29Q80T74 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klhl29Q80T74 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klhl29Q80T74 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klhl29Q80T74 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klhl29Q80T74 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klhl29Q80T74 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Klhl29Q80T74 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klhl29Q80T74 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klhl29Q80T74 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Klhl29Q80T74 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Klhl29Q80T74 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klhl29Q80T74 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klhl29Q80T74 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Klhl29Q80T74 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Klhl29Q80T74 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Klhl29Q80T74 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Klhl29Q80T74 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Klhl29Q80T74 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Klhl29Q80T74 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Klhl29Q80T74 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Klhl29Q80T74 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Klhl29Q80T74 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Klhl29Q80T74 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Klhl29Q80T74 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Klhl29Q80T74 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Klhl29Q80T74 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Klhl29Q80T74 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Klhl29Q80T74 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Klhl29Q80T74 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Klhl29Q80T74 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Klhl29Q80T74 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Klhl29Q80T74 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Klhl29Q80T74 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Klhl29Q80T74 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Klhl29Q80T74 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Klhl29Q80T74 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Klhl29Q80T74 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Klhl29Q80T74 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Klhl29Q80T74 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 132 ms