Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH3

Znf516, Zinc finger protein 516, mousemouse

Predictions only

Length 1,157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf516Q7TSH3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Znf516Q7TSH3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Znf516Q7TSH3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Znf516Q7TSH3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Znf516Q7TSH3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Znf516Q7TSH3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Znf516Q7TSH3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Znf516Q7TSH3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Znf516Q7TSH3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Znf516Q7TSH3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Znf516Q7TSH3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Znf516Q7TSH3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Znf516Q7TSH3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Znf516Q7TSH3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Znf516Q7TSH3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Znf516Q7TSH3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Znf516Q7TSH3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Znf516Q7TSH3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Znf516Q7TSH3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Znf516Q7TSH3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Znf516Q7TSH3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Znf516Q7TSH3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Znf516Q7TSH3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Znf516Q7TSH3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Znf516Q7TSH3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Znf516Q7TSH3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Znf516Q7TSH3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Znf516Q7TSH3 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Znf516Q7TSH3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Znf516Q7TSH3 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Znf516Q7TSH3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Znf516Q7TSH3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Znf516Q7TSH3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Znf516Q7TSH3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Znf516Q7TSH3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Znf516Q7TSH3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Znf516Q7TSH3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Znf516Q7TSH3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Znf516Q7TSH3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Znf516Q7TSH3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Znf516Q7TSH3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Znf516Q7TSH3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Znf516Q7TSH3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Znf516Q7TSH3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Znf516Q7TSH3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Znf516Q7TSH3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Znf516Q7TSH3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Znf516Q7TSH3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Znf516Q7TSH3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Znf516Q7TSH3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Znf516Q7TSH3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Znf516Q7TSH3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Znf516Q7TSH3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Znf516Q7TSH3 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Znf516Q7TSH3 Vmn1r-ps10-201ENSMUST00000176165 889 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Znf516Q7TSH3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Znf516Q7TSH3 4921527H02Rik-201ENSMUST00000196028 246 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Znf516Q7TSH3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Znf516Q7TSH3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Znf516Q7TSH3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Znf516Q7TSH3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Znf516Q7TSH3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Znf516Q7TSH3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Znf516Q7TSH3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Znf516Q7TSH3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Znf516Q7TSH3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Znf516Q7TSH3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Znf516Q7TSH3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Znf516Q7TSH3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Znf516Q7TSH3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Znf516Q7TSH3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Znf516Q7TSH3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Znf516Q7TSH3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Znf516Q7TSH3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Znf516Q7TSH3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Znf516Q7TSH3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Znf516Q7TSH3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Znf516Q7TSH3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Znf516Q7TSH3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Znf516Q7TSH3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Znf516Q7TSH3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Znf516Q7TSH3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Znf516Q7TSH3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Znf516Q7TSH3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Znf516Q7TSH3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Znf516Q7TSH3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Znf516Q7TSH3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Znf516Q7TSH3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Znf516Q7TSH3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Znf516Q7TSH3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Znf516Q7TSH3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Znf516Q7TSH3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Znf516Q7TSH3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Znf516Q7TSH3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Znf516Q7TSH3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Znf516Q7TSH3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Znf516Q7TSH3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Znf516Q7TSH3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Znf516Q7TSH3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Znf516Q7TSH3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms