Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWR4

Ppp2r2b, Serine/threonine-protein phosphatase 2A 55 kDa regulatory subunit B beta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp2r2bQ6ZWR4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppp2r2bQ6ZWR4 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppp2r2bQ6ZWR4 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppp2r2bQ6ZWR4 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppp2r2bQ6ZWR4 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppp2r2bQ6ZWR4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppp2r2bQ6ZWR4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppp2r2bQ6ZWR4 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppp2r2bQ6ZWR4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppp2r2bQ6ZWR4 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppp2r2bQ6ZWR4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppp2r2bQ6ZWR4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppp2r2bQ6ZWR4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppp2r2bQ6ZWR4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppp2r2bQ6ZWR4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppp2r2bQ6ZWR4 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppp2r2bQ6ZWR4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppp2r2bQ6ZWR4 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppp2r2bQ6ZWR4 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppp2r2bQ6ZWR4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppp2r2bQ6ZWR4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppp2r2bQ6ZWR4 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppp2r2bQ6ZWR4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppp2r2bQ6ZWR4 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppp2r2bQ6ZWR4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppp2r2bQ6ZWR4 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppp2r2bQ6ZWR4 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppp2r2bQ6ZWR4 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppp2r2bQ6ZWR4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppp2r2bQ6ZWR4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppp2r2bQ6ZWR4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppp2r2bQ6ZWR4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppp2r2bQ6ZWR4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppp2r2bQ6ZWR4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppp2r2bQ6ZWR4 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppp2r2bQ6ZWR4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppp2r2bQ6ZWR4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppp2r2bQ6ZWR4 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppp2r2bQ6ZWR4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppp2r2bQ6ZWR4 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppp2r2bQ6ZWR4 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppp2r2bQ6ZWR4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppp2r2bQ6ZWR4 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppp2r2bQ6ZWR4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppp2r2bQ6ZWR4 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppp2r2bQ6ZWR4 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppp2r2bQ6ZWR4 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppp2r2bQ6ZWR4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppp2r2bQ6ZWR4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppp2r2bQ6ZWR4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppp2r2bQ6ZWR4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppp2r2bQ6ZWR4 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppp2r2bQ6ZWR4 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppp2r2bQ6ZWR4 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppp2r2bQ6ZWR4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppp2r2bQ6ZWR4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppp2r2bQ6ZWR4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppp2r2bQ6ZWR4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ppp2r2bQ6ZWR4 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppp2r2bQ6ZWR4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppp2r2bQ6ZWR4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppp2r2bQ6ZWR4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppp2r2bQ6ZWR4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppp2r2bQ6ZWR4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppp2r2bQ6ZWR4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppp2r2bQ6ZWR4 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppp2r2bQ6ZWR4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppp2r2bQ6ZWR4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppp2r2bQ6ZWR4 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppp2r2bQ6ZWR4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppp2r2bQ6ZWR4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppp2r2bQ6ZWR4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppp2r2bQ6ZWR4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppp2r2bQ6ZWR4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppp2r2bQ6ZWR4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppp2r2bQ6ZWR4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppp2r2bQ6ZWR4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppp2r2bQ6ZWR4 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppp2r2bQ6ZWR4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppp2r2bQ6ZWR4 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppp2r2bQ6ZWR4 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppp2r2bQ6ZWR4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppp2r2bQ6ZWR4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppp2r2bQ6ZWR4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppp2r2bQ6ZWR4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.2 ms