Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q6P435 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q6P435 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q6P435 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q6P435 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q6P435 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Q6P435 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Q6P435 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q6P435 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q6P435 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q6P435 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q6P435 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Q6P435 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q6P435 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q6P435 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q6P435 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q6P435 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q6P435 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q6P435 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q6P435 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q6P435 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q6P435 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q6P435 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q6P435 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q6P435 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q6P435 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q6P435 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q6P435 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Q6P435 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q6P435 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q6P435 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q6P435 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q6P435 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q6P435 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q6P435 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q6P435 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q6P435 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q6P435 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q6P435 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q6P435 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q6P435 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q6P435 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q6P435 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q6P435 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q6P435 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q6P435 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q6P435 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q6P435 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q6P435 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q6P435 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Q6P435 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q6P435 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q6P435 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q6P435 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q6P435 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q6P435 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q6P435 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q6P435 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q6P435 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q6P435 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q6P435 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q6P435 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q6P435 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q6P435 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q6P435 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q6P435 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q6P435 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q6P435 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q6P435 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q6P435 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q6P435 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q6P435 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q6P435 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q6P435 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q6P435 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q6P435 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q6P435 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q6P435 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q6P435 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q6P435 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q6P435 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q6P435 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q6P435 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q6P435 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q6P435 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Q6P435 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q6P435 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Q6P435 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q6P435 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q6P435 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q6P435 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q6P435 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q6P435 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q6P435 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q6P435 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q6P435 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Q6P435 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q6P435 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q6P435 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q6P435 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms