Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Arhgap20Q6IFT4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Arhgap20Q6IFT4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Arhgap20Q6IFT4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Arhgap20Q6IFT4 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Arhgap20Q6IFT4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Arhgap20Q6IFT4 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Arhgap20Q6IFT4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Arhgap20Q6IFT4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Arhgap20Q6IFT4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Arhgap20Q6IFT4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Arhgap20Q6IFT4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Arhgap20Q6IFT4 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Arhgap20Q6IFT4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Arhgap20Q6IFT4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Arhgap20Q6IFT4 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Arhgap20Q6IFT4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Arhgap20Q6IFT4 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Arhgap20Q6IFT4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Arhgap20Q6IFT4 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Arhgap20Q6IFT4 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Arhgap20Q6IFT4 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Arhgap20Q6IFT4 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Arhgap20Q6IFT4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Arhgap20Q6IFT4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Arhgap20Q6IFT4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Arhgap20Q6IFT4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Arhgap20Q6IFT4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Arhgap20Q6IFT4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Arhgap20Q6IFT4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Arhgap20Q6IFT4 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Arhgap20Q6IFT4 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Arhgap20Q6IFT4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Arhgap20Q6IFT4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Arhgap20Q6IFT4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Arhgap20Q6IFT4 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Arhgap20Q6IFT4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Arhgap20Q6IFT4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Arhgap20Q6IFT4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Arhgap20Q6IFT4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Arhgap20Q6IFT4 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Arhgap20Q6IFT4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Arhgap20Q6IFT4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Arhgap20Q6IFT4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Arhgap20Q6IFT4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Arhgap20Q6IFT4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Arhgap20Q6IFT4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Arhgap20Q6IFT4 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Arhgap20Q6IFT4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Arhgap20Q6IFT4 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Arhgap20Q6IFT4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Arhgap20Q6IFT4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Arhgap20Q6IFT4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Arhgap20Q6IFT4 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Arhgap20Q6IFT4 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Arhgap20Q6IFT4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Arhgap20Q6IFT4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Arhgap20Q6IFT4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Arhgap20Q6IFT4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Arhgap20Q6IFT4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Arhgap20Q6IFT4 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Arhgap20Q6IFT4 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Arhgap20Q6IFT4 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Arhgap20Q6IFT4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Arhgap20Q6IFT4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Arhgap20Q6IFT4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Arhgap20Q6IFT4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Arhgap20Q6IFT4 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Arhgap20Q6IFT4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Arhgap20Q6IFT4 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Arhgap20Q6IFT4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Arhgap20Q6IFT4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Arhgap20Q6IFT4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Arhgap20Q6IFT4 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Arhgap20Q6IFT4 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Arhgap20Q6IFT4 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Arhgap20Q6IFT4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Arhgap20Q6IFT4 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Arhgap20Q6IFT4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Arhgap20Q6IFT4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Arhgap20Q6IFT4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Arhgap20Q6IFT4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Arhgap20Q6IFT4 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Arhgap20Q6IFT4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Arhgap20Q6IFT4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Arhgap20Q6IFT4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Arhgap20Q6IFT4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Arhgap20Q6IFT4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Arhgap20Q6IFT4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Arhgap20Q6IFT4 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Arhgap20Q6IFT4 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Arhgap20Q6IFT4 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Arhgap20Q6IFT4 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Arhgap20Q6IFT4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Arhgap20Q6IFT4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Arhgap20Q6IFT4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Arhgap20Q6IFT4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Arhgap20Q6IFT4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Arhgap20Q6IFT4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Arhgap20Q6IFT4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms