Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS6

Sv2c, Synaptic vesicle glycoprotein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2cQ69ZS6 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sv2cQ69ZS6 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sv2cQ69ZS6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sv2cQ69ZS6 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sv2cQ69ZS6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sv2cQ69ZS6 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sv2cQ69ZS6 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sv2cQ69ZS6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sv2cQ69ZS6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sv2cQ69ZS6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sv2cQ69ZS6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sv2cQ69ZS6 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Sv2cQ69ZS6 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Sv2cQ69ZS6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sv2cQ69ZS6 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sv2cQ69ZS6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sv2cQ69ZS6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sv2cQ69ZS6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sv2cQ69ZS6 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sv2cQ69ZS6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sv2cQ69ZS6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sv2cQ69ZS6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sv2cQ69ZS6 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sv2cQ69ZS6 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Sv2cQ69ZS6 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Sv2cQ69ZS6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sv2cQ69ZS6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sv2cQ69ZS6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sv2cQ69ZS6 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sv2cQ69ZS6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sv2cQ69ZS6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sv2cQ69ZS6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sv2cQ69ZS6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sv2cQ69ZS6 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sv2cQ69ZS6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sv2cQ69ZS6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sv2cQ69ZS6 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sv2cQ69ZS6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sv2cQ69ZS6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sv2cQ69ZS6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sv2cQ69ZS6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sv2cQ69ZS6 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sv2cQ69ZS6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sv2cQ69ZS6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sv2cQ69ZS6 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Sv2cQ69ZS6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sv2cQ69ZS6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sv2cQ69ZS6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sv2cQ69ZS6 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sv2cQ69ZS6 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sv2cQ69ZS6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sv2cQ69ZS6 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sv2cQ69ZS6 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sv2cQ69ZS6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sv2cQ69ZS6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sv2cQ69ZS6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sv2cQ69ZS6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sv2cQ69ZS6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sv2cQ69ZS6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sv2cQ69ZS6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sv2cQ69ZS6 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sv2cQ69ZS6 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sv2cQ69ZS6 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sv2cQ69ZS6 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Sv2cQ69ZS6 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Sv2cQ69ZS6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sv2cQ69ZS6 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sv2cQ69ZS6 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sv2cQ69ZS6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sv2cQ69ZS6 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sv2cQ69ZS6 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Sv2cQ69ZS6 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sv2cQ69ZS6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sv2cQ69ZS6 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Sv2cQ69ZS6 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sv2cQ69ZS6 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sv2cQ69ZS6 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sv2cQ69ZS6 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sv2cQ69ZS6 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sv2cQ69ZS6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sv2cQ69ZS6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Sv2cQ69ZS6 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sv2cQ69ZS6 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sv2cQ69ZS6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sv2cQ69ZS6 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sv2cQ69ZS6 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sv2cQ69ZS6 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sv2cQ69ZS6 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sv2cQ69ZS6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sv2cQ69ZS6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sv2cQ69ZS6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sv2cQ69ZS6 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sv2cQ69ZS6 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sv2cQ69ZS6 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sv2cQ69ZS6 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sv2cQ69ZS6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Sv2cQ69ZS6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sv2cQ69ZS6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sv2cQ69ZS6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sv2cQ69ZS6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms