Protein–RNA interactions for Protein: Q62468

Vil1, Villin-1, mousemouse

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vil1Q62468 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vil1Q62468 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vil1Q62468 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vil1Q62468 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vil1Q62468 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vil1Q62468 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vil1Q62468 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vil1Q62468 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vil1Q62468 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vil1Q62468 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Vil1Q62468 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vil1Q62468 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Vil1Q62468 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vil1Q62468 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vil1Q62468 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vil1Q62468 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vil1Q62468 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vil1Q62468 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vil1Q62468 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Vil1Q62468 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vil1Q62468 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vil1Q62468 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vil1Q62468 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Vil1Q62468 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vil1Q62468 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vil1Q62468 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vil1Q62468 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vil1Q62468 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vil1Q62468 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Vil1Q62468 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vil1Q62468 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vil1Q62468 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vil1Q62468 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vil1Q62468 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vil1Q62468 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vil1Q62468 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vil1Q62468 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vil1Q62468 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Vil1Q62468 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vil1Q62468 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vil1Q62468 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vil1Q62468 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vil1Q62468 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vil1Q62468 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vil1Q62468 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Vil1Q62468 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vil1Q62468 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Vil1Q62468 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vil1Q62468 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vil1Q62468 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vil1Q62468 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vil1Q62468 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vil1Q62468 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vil1Q62468 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vil1Q62468 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vil1Q62468 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vil1Q62468 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vil1Q62468 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Vil1Q62468 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vil1Q62468 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vil1Q62468 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vil1Q62468 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vil1Q62468 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vil1Q62468 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vil1Q62468 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vil1Q62468 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vil1Q62468 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Vil1Q62468 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vil1Q62468 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Vil1Q62468 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Vil1Q62468 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vil1Q62468 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vil1Q62468 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vil1Q62468 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vil1Q62468 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vil1Q62468 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vil1Q62468 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vil1Q62468 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vil1Q62468 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vil1Q62468 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vil1Q62468 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vil1Q62468 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vil1Q62468 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vil1Q62468 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vil1Q62468 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vil1Q62468 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vil1Q62468 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Vil1Q62468 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vil1Q62468 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vil1Q62468 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vil1Q62468 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vil1Q62468 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vil1Q62468 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vil1Q62468 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vil1Q62468 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vil1Q62468 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vil1Q62468 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Vil1Q62468 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vil1Q62468 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Vil1Q62468 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms