Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWA4

Trim40, Tripartite motif-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim40Q3UWA4 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim40Q3UWA4 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim40Q3UWA4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim40Q3UWA4 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim40Q3UWA4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim40Q3UWA4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim40Q3UWA4 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim40Q3UWA4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim40Q3UWA4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim40Q3UWA4 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Trim40Q3UWA4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim40Q3UWA4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim40Q3UWA4 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim40Q3UWA4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim40Q3UWA4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim40Q3UWA4 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim40Q3UWA4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim40Q3UWA4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim40Q3UWA4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim40Q3UWA4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim40Q3UWA4 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim40Q3UWA4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim40Q3UWA4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim40Q3UWA4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim40Q3UWA4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim40Q3UWA4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim40Q3UWA4 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim40Q3UWA4 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim40Q3UWA4 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim40Q3UWA4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim40Q3UWA4 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim40Q3UWA4 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim40Q3UWA4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim40Q3UWA4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim40Q3UWA4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim40Q3UWA4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim40Q3UWA4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim40Q3UWA4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim40Q3UWA4 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim40Q3UWA4 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim40Q3UWA4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim40Q3UWA4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim40Q3UWA4 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim40Q3UWA4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim40Q3UWA4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim40Q3UWA4 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim40Q3UWA4 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim40Q3UWA4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim40Q3UWA4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim40Q3UWA4 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim40Q3UWA4 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim40Q3UWA4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim40Q3UWA4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim40Q3UWA4 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim40Q3UWA4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim40Q3UWA4 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim40Q3UWA4 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim40Q3UWA4 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim40Q3UWA4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim40Q3UWA4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim40Q3UWA4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim40Q3UWA4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim40Q3UWA4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim40Q3UWA4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim40Q3UWA4 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim40Q3UWA4 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim40Q3UWA4 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim40Q3UWA4 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim40Q3UWA4 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim40Q3UWA4 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim40Q3UWA4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Trim40Q3UWA4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Trim40Q3UWA4 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim40Q3UWA4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim40Q3UWA4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim40Q3UWA4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim40Q3UWA4 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim40Q3UWA4 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim40Q3UWA4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim40Q3UWA4 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim40Q3UWA4 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim40Q3UWA4 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim40Q3UWA4 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim40Q3UWA4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim40Q3UWA4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim40Q3UWA4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim40Q3UWA4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim40Q3UWA4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim40Q3UWA4 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim40Q3UWA4 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim40Q3UWA4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim40Q3UWA4 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim40Q3UWA4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim40Q3UWA4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim40Q3UWA4 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim40Q3UWA4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim40Q3UWA4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim40Q3UWA4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim40Q3UWA4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim40Q3UWA4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms