Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW77

Gm12888, MCG59630, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm12888Q3UW77 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm12888Q3UW77 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm12888Q3UW77 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm12888Q3UW77 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm12888Q3UW77 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm12888Q3UW77 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm12888Q3UW77 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm12888Q3UW77 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm12888Q3UW77 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm12888Q3UW77 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm12888Q3UW77 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm12888Q3UW77 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm12888Q3UW77 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm12888Q3UW77 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm12888Q3UW77 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm12888Q3UW77 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm12888Q3UW77 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm12888Q3UW77 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm12888Q3UW77 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm12888Q3UW77 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm12888Q3UW77 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm12888Q3UW77 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm12888Q3UW77 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm12888Q3UW77 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm12888Q3UW77 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm12888Q3UW77 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm12888Q3UW77 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm12888Q3UW77 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm12888Q3UW77 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm12888Q3UW77 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm12888Q3UW77 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm12888Q3UW77 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm12888Q3UW77 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm12888Q3UW77 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm12888Q3UW77 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm12888Q3UW77 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm12888Q3UW77 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm12888Q3UW77 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm12888Q3UW77 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm12888Q3UW77 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm12888Q3UW77 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm12888Q3UW77 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm12888Q3UW77 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm12888Q3UW77 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm12888Q3UW77 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm12888Q3UW77 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Gm12888Q3UW77 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm12888Q3UW77 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm12888Q3UW77 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm12888Q3UW77 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Gm12888Q3UW77 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm12888Q3UW77 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm12888Q3UW77 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Gm12888Q3UW77 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm12888Q3UW77 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Gm12888Q3UW77 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm12888Q3UW77 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Gm12888Q3UW77 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm12888Q3UW77 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm12888Q3UW77 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Gm12888Q3UW77 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm12888Q3UW77 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm12888Q3UW77 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Gm12888Q3UW77 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm12888Q3UW77 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm12888Q3UW77 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm12888Q3UW77 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm12888Q3UW77 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm12888Q3UW77 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm12888Q3UW77 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm12888Q3UW77 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm12888Q3UW77 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm12888Q3UW77 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm12888Q3UW77 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm12888Q3UW77 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm12888Q3UW77 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm12888Q3UW77 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm12888Q3UW77 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm12888Q3UW77 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm12888Q3UW77 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm12888Q3UW77 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm12888Q3UW77 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm12888Q3UW77 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm12888Q3UW77 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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