Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc34Q3UI66 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc34Q3UI66 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc34Q3UI66 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc34Q3UI66 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc34Q3UI66 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc34Q3UI66 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc34Q3UI66 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc34Q3UI66 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc34Q3UI66 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc34Q3UI66 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc34Q3UI66 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc34Q3UI66 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc34Q3UI66 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc34Q3UI66 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc34Q3UI66 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc34Q3UI66 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc34Q3UI66 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc34Q3UI66 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc34Q3UI66 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc34Q3UI66 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc34Q3UI66 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc34Q3UI66 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc34Q3UI66 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc34Q3UI66 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc34Q3UI66 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc34Q3UI66 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc34Q3UI66 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc34Q3UI66 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc34Q3UI66 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc34Q3UI66 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc34Q3UI66 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc34Q3UI66 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc34Q3UI66 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc34Q3UI66 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc34Q3UI66 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc34Q3UI66 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc34Q3UI66 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc34Q3UI66 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc34Q3UI66 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc34Q3UI66 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc34Q3UI66 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc34Q3UI66 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc34Q3UI66 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc34Q3UI66 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc34Q3UI66 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc34Q3UI66 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc34Q3UI66 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc34Q3UI66 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc34Q3UI66 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc34Q3UI66 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc34Q3UI66 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc34Q3UI66 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc34Q3UI66 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc34Q3UI66 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc34Q3UI66 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc34Q3UI66 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc34Q3UI66 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc34Q3UI66 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc34Q3UI66 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc34Q3UI66 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc34Q3UI66 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc34Q3UI66 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc34Q3UI66 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc34Q3UI66 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc34Q3UI66 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc34Q3UI66 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc34Q3UI66 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc34Q3UI66 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc34Q3UI66 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc34Q3UI66 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc34Q3UI66 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc34Q3UI66 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc34Q3UI66 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Ccdc34Q3UI66 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Ccdc34Q3UI66 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc34Q3UI66 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc34Q3UI66 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc34Q3UI66 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc34Q3UI66 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc34Q3UI66 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc34Q3UI66 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc34Q3UI66 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc34Q3UI66 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc34Q3UI66 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc34Q3UI66 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc34Q3UI66 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc34Q3UI66 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc34Q3UI66 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc34Q3UI66 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc34Q3UI66 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc34Q3UI66 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc34Q3UI66 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc34Q3UI66 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc34Q3UI66 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc34Q3UI66 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc34Q3UI66 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc34Q3UI66 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc34Q3UI66 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc34Q3UI66 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms