Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV1

NBPF20, Neuroblastoma breakpoint family member 20, humanhuman

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF20Q3BBV1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NBPF20Q3BBV1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NBPF20Q3BBV1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NBPF20Q3BBV1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NBPF20Q3BBV1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NBPF20Q3BBV1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NBPF20Q3BBV1 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NBPF20Q3BBV1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NBPF20Q3BBV1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NBPF20Q3BBV1 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NBPF20Q3BBV1 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NBPF20Q3BBV1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NBPF20Q3BBV1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NBPF20Q3BBV1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NBPF20Q3BBV1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NBPF20Q3BBV1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NBPF20Q3BBV1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NBPF20Q3BBV1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NBPF20Q3BBV1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NBPF20Q3BBV1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NBPF20Q3BBV1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NBPF20Q3BBV1 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NBPF20Q3BBV1 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NBPF20Q3BBV1 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NBPF20Q3BBV1 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NBPF20Q3BBV1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NBPF20Q3BBV1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NBPF20Q3BBV1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NBPF20Q3BBV1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NBPF20Q3BBV1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NBPF20Q3BBV1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NBPF20Q3BBV1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NBPF20Q3BBV1 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NBPF20Q3BBV1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NBPF20Q3BBV1 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NBPF20Q3BBV1 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NBPF20Q3BBV1 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NBPF20Q3BBV1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NBPF20Q3BBV1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NBPF20Q3BBV1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NBPF20Q3BBV1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NBPF20Q3BBV1 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NBPF20Q3BBV1 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NBPF20Q3BBV1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NBPF20Q3BBV1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NBPF20Q3BBV1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NBPF20Q3BBV1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NBPF20Q3BBV1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NBPF20Q3BBV1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NBPF20Q3BBV1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NBPF20Q3BBV1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NBPF20Q3BBV1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NBPF20Q3BBV1 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NBPF20Q3BBV1 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NBPF20Q3BBV1 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NBPF20Q3BBV1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NBPF20Q3BBV1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NBPF20Q3BBV1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NBPF20Q3BBV1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NBPF20Q3BBV1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NBPF20Q3BBV1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NBPF20Q3BBV1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NBPF20Q3BBV1 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NBPF20Q3BBV1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NBPF20Q3BBV1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NBPF20Q3BBV1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NBPF20Q3BBV1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NBPF20Q3BBV1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NBPF20Q3BBV1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NBPF20Q3BBV1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NBPF20Q3BBV1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NBPF20Q3BBV1 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NBPF20Q3BBV1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NBPF20Q3BBV1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NBPF20Q3BBV1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NBPF20Q3BBV1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NBPF20Q3BBV1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NBPF20Q3BBV1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NBPF20Q3BBV1 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NBPF20Q3BBV1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NBPF20Q3BBV1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NBPF20Q3BBV1 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NBPF20Q3BBV1 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NBPF20Q3BBV1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NBPF20Q3BBV1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NBPF20Q3BBV1 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NBPF20Q3BBV1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NBPF20Q3BBV1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NBPF20Q3BBV1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NBPF20Q3BBV1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NBPF20Q3BBV1 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NBPF20Q3BBV1 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NBPF20Q3BBV1 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NBPF20Q3BBV1 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NBPF20Q3BBV1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NBPF20Q3BBV1 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NBPF20Q3BBV1 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NBPF20Q3BBV1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NBPF20Q3BBV1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NBPF20Q3BBV1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms