Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKI2

Vax1, Ventral anterior homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax1Q2NKI2 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Vax1Q2NKI2 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vax1Q2NKI2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vax1Q2NKI2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vax1Q2NKI2 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vax1Q2NKI2 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vax1Q2NKI2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vax1Q2NKI2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vax1Q2NKI2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vax1Q2NKI2 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vax1Q2NKI2 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vax1Q2NKI2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vax1Q2NKI2 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vax1Q2NKI2 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vax1Q2NKI2 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Vax1Q2NKI2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vax1Q2NKI2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vax1Q2NKI2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vax1Q2NKI2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vax1Q2NKI2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vax1Q2NKI2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vax1Q2NKI2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vax1Q2NKI2 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vax1Q2NKI2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vax1Q2NKI2 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Vax1Q2NKI2 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vax1Q2NKI2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vax1Q2NKI2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vax1Q2NKI2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vax1Q2NKI2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vax1Q2NKI2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vax1Q2NKI2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vax1Q2NKI2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vax1Q2NKI2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vax1Q2NKI2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vax1Q2NKI2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vax1Q2NKI2 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vax1Q2NKI2 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vax1Q2NKI2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vax1Q2NKI2 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Vax1Q2NKI2 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vax1Q2NKI2 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vax1Q2NKI2 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vax1Q2NKI2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vax1Q2NKI2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vax1Q2NKI2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vax1Q2NKI2 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vax1Q2NKI2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vax1Q2NKI2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vax1Q2NKI2 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Vax1Q2NKI2 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Vax1Q2NKI2 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vax1Q2NKI2 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Vax1Q2NKI2 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Vax1Q2NKI2 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vax1Q2NKI2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vax1Q2NKI2 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Vax1Q2NKI2 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vax1Q2NKI2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vax1Q2NKI2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vax1Q2NKI2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Vax1Q2NKI2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vax1Q2NKI2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vax1Q2NKI2 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vax1Q2NKI2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vax1Q2NKI2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vax1Q2NKI2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vax1Q2NKI2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vax1Q2NKI2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vax1Q2NKI2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vax1Q2NKI2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vax1Q2NKI2 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vax1Q2NKI2 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vax1Q2NKI2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Vax1Q2NKI2 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vax1Q2NKI2 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vax1Q2NKI2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vax1Q2NKI2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vax1Q2NKI2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vax1Q2NKI2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vax1Q2NKI2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vax1Q2NKI2 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vax1Q2NKI2 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vax1Q2NKI2 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vax1Q2NKI2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vax1Q2NKI2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vax1Q2NKI2 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Vax1Q2NKI2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Vax1Q2NKI2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vax1Q2NKI2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vax1Q2NKI2 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vax1Q2NKI2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vax1Q2NKI2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vax1Q2NKI2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vax1Q2NKI2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vax1Q2NKI2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vax1Q2NKI2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vax1Q2NKI2 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vax1Q2NKI2 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vax1Q2NKI2 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms