Protein–RNA interactions for Protein: Q12441

TY1A-DR3, Transposon Ty1-DR3 Gag polyprotein, yeastyeast

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-DR3Q12441 THI22YPR121W 1719 nt5.94□□□□□ -1.46
TY1A-DR3Q12441 PAC2YER007W 1557 nt5.94□□□□□ -1.46
TY1A-DR3Q12441 GCD10YNL062C 1437 nt5.94□□□□□ -1.46
TY1A-DR3Q12441 TMA20YER007C-A 546 nt5.94□□□□□ -1.46
TY1A-DR3Q12441 FAU1YER183C 636 nt5.94□□□□□ -1.46
TY1A-DR3Q12441 RPN12YFR052W 825 nt5.94□□□□□ -1.46
TY1A-DR3Q12441 HOP2YGL033W 657 nt5.94□□□□□ -1.46
TY1A-DR3Q12441 PIH1YHR034C 1035 nt5.94□□□□□ -1.46
TY1A-DR3Q12441 HIS6YIL020C 786 nt5.94□□□□□ -1.46
TY1A-DR3Q12441 MCM22YJR135C 720 nt5.94□□□□□ -1.46
TY1A-DR3Q12441 PTH2YBL057C 627 nt5.94□□□□□ -1.46
TY1A-DR3Q12441 ATG3YNR007C 933 nt5.94□□□□□ -1.46
TY1A-DR3Q12441 LSP1YPL004C 1026 nt5.94□□□□□ -1.46
TY1A-DR3Q12441 SKI2YLR398C 3864 nt5.94□□□□□ -1.46
TY1A-DR3Q12441 GEX1YCL073C 1848 nt5.94□□□□□ -1.46
TY1A-DR3Q12441 TUF1YOR187W 1314 nt5.94□□□□□ -1.46
TY1A-DR3Q12441 YDR444WYDR444W 2064 nt5.94□□□□□ -1.46
TY1A-DR3Q12441 LTV1YKL143W 1392 nt5.93□□□□□ -1.46
TY1A-DR3Q12441 UME1YPL139C 1383 nt5.93□□□□□ -1.46
TY1A-DR3Q12441 RPL35BYDL136W 363 nt5.93□□□□□ -1.46
TY1A-DR3Q12441 snR82snR82 268 nt5.93□□□□□ -1.46
TY1A-DR3Q12441 tA(AGC)DtA(AGC)D 73 nt5.93□□□□□ -1.46
TY1A-DR3Q12441 tA(AGC)FtA(AGC)F 73 nt5.93□□□□□ -1.46
TY1A-DR3Q12441 tA(AGC)GtA(AGC)G 73 nt5.93□□□□□ -1.46
TY1A-DR3Q12441 tA(AGC)HtA(AGC)H 73 nt5.93□□□□□ -1.46
TY1A-DR3Q12441 tA(AGC)JtA(AGC)J 73 nt5.93□□□□□ -1.46
TY1A-DR3Q12441 tA(AGC)K1tA(AGC)K1 73 nt5.93□□□□□ -1.46
TY1A-DR3Q12441 tA(AGC)K2tA(AGC)K2 73 nt5.93□□□□□ -1.46
TY1A-DR3Q12441 tA(AGC)LtA(AGC)L 73 nt5.93□□□□□ -1.46
TY1A-DR3Q12441 tA(AGC)M1tA(AGC)M1 73 nt5.93□□□□□ -1.46
TY1A-DR3Q12441 tA(AGC)M2tA(AGC)M2 73 nt5.93□□□□□ -1.46
TY1A-DR3Q12441 tA(AGC)PtA(AGC)P 73 nt5.93□□□□□ -1.46
TY1A-DR3Q12441 GIR2YDR152W 798 nt5.93□□□□□ -1.46
TY1A-DR3Q12441 THR1YHR025W 1074 nt5.93□□□□□ -1.46
TY1A-DR3Q12441 SDP1YIL113W 630 nt5.93□□□□□ -1.46
TY1A-DR3Q12441 YBL070CYBL070C 321 nt5.93□□□□□ -1.46
TY1A-DR3Q12441 UGA3YDL170W 1587 nt5.93□□□□□ -1.46
TY1A-DR3Q12441 CDC40YDR364C 1368 nt5.93□□□□□ -1.46
TY1A-DR3Q12441 GDI1YER136W 1356 nt5.93□□□□□ -1.46
TY1A-DR3Q12441 AGE1YDR524C 1449 nt5.92□□□□□ -1.46
TY1A-DR3Q12441 RMD9YGL107C 1941 nt5.92□□□□□ -1.46
TY1A-DR3Q12441 HPT1YDR399W 666 nt5.92□□□□□ -1.46
TY1A-DR3Q12441 SUF3tG(CCC)D 72 nt5.92□□□□□ -1.46
TY1A-DR3Q12441 RPL27BYDR471W 411 nt5.92□□□□□ -1.46
TY1A-DR3Q12441 YEL008WYEL008W 381 nt5.92□□□□□ -1.46
TY1A-DR3Q12441 DMA1YHR115C 1251 nt5.92□□□□□ -1.46
TY1A-DR3Q12441 CAP2YIL034C 864 nt5.92□□□□□ -1.46
TY1A-DR3Q12441 GCD14YJL125C 1152 nt5.92□□□□□ -1.46
TY1A-DR3Q12441 FLD1YLR404W 858 nt5.92□□□□□ -1.46
TY1A-DR3Q12441 MRPL44YMR225C 297 nt5.92□□□□□ -1.46
TY1A-DR3Q12441 COX5AYNL052W 462 nt5.92□□□□□ -1.46
TY1A-DR3Q12441 RPS6AYPL090C 711 nt5.92□□□□□ -1.46
TY1A-DR3Q12441 SEC66YBR171W 621 nt5.92□□□□□ -1.46
TY1A-DR3Q12441 RPS6BYBR181C 711 nt5.92□□□□□ -1.46
TY1A-DR3Q12441 SAS10YDL153C 1833 nt5.92□□□□□ -1.46
TY1A-DR3Q12441 ISN1YOR155C 1353 nt5.92□□□□□ -1.46
TY1A-DR3Q12441 QRI1YDL103C 1434 nt5.91□□□□□ -1.46
TY1A-DR3Q12441 AIM7YDR063W 450 nt5.91□□□□□ -1.46
TY1A-DR3Q12441 YER145C-AYER145C-A 438 nt5.91□□□□□ -1.46
TY1A-DR3Q12441 QCR6YFR033C 444 nt5.91□□□□□ -1.46
TY1A-DR3Q12441 AML1YGR001C 747 nt5.91□□□□□ -1.46
TY1A-DR3Q12441 YGR018CYGR018C 330 nt5.91□□□□□ -1.46
TY1A-DR3Q12441 AAT2YLR027C 1257 nt5.91□□□□□ -1.46
TY1A-DR3Q12441 YLR317WYLR317W 435 nt5.91□□□□□ -1.46
TY1A-DR3Q12441 IMP1YMR150C 573 nt5.91□□□□□ -1.46
TY1A-DR3Q12441 TOS6YNL300W 309 nt5.91□□□□□ -1.46
TY1A-DR3Q12441 BRX1YOL077C 876 nt5.91□□□□□ -1.46
TY1A-DR3Q12441 RGS2YOR107W 930 nt5.91□□□□□ -1.46
TY1A-DR3Q12441 SYC1YOR179C 567 nt5.91□□□□□ -1.46
TY1A-DR3Q12441 PBN1YCL052C 1251 nt5.91□□□□□ -1.46
TY1A-DR3Q12441 SRP101YDR292C 1866 nt5.91□□□□□ -1.46
TY1A-DR3Q12441 TBF1YPL128C 1689 nt5.91□□□□□ -1.46
TY1A-DR3Q12441 ARP4YJL081C 1470 nt5.9□□□□□ -1.46
TY1A-DR3Q12441 ATP2YJR121W 1536 nt5.9□□□□□ -1.46
TY1A-DR3Q12441 PDH1YPR002W 1551 nt5.9□□□□□ -1.46
TY1A-DR3Q12441 YJL144WYJL144W 315 nt5.9□□□□□ -1.46
TY1A-DR3Q12441 CYC3YAL039C 810 nt5.9□□□□□ -1.46
TY1A-DR3Q12441 YPT7YML001W 627 nt5.9□□□□□ -1.46
TY1A-DR3Q12441 CPR3YML078W 549 nt5.9□□□□□ -1.46
TY1A-DR3Q12441 NGL1YOL042W 1092 nt5.9□□□□□ -1.46
TY1A-DR3Q12441 YPR197CYPR197C 564 nt5.9□□□□□ -1.46
TY1A-DR3Q12441 TRE2YOR256C 2430 nt5.9□□□□□ -1.47
TY1A-DR3Q12441 AVT5YBL089W 1380 nt5.9□□□□□ -1.47
TY1A-DR3Q12441 TPO3YPR156C 1869 nt5.9□□□□□ -1.47
TY1A-DR3Q12441 STB5YHR178W 2232 nt5.89□□□□□ -1.47
TY1A-DR3Q12441 KNH1YDL049C 807 nt5.89□□□□□ -1.47
TY1A-DR3Q12441 VFA1YER128W 612 nt5.89□□□□□ -1.47
TY1A-DR3Q12441 TMT1YER175C 900 nt5.89□□□□□ -1.47
TY1A-DR3Q12441 YGR127WYGR127W 939 nt5.89□□□□□ -1.47
TY1A-DR3Q12441 YIL068W-AYIL068W-A 384 nt5.89□□□□□ -1.47
TY1A-DR3Q12441 SOP4YJL192C 705 nt5.89□□□□□ -1.47
TY1A-DR3Q12441 YKL177WYKL177W 339 nt5.89□□□□□ -1.47
TY1A-DR3Q12441 YLR287CYLR287C 1068 nt5.89□□□□□ -1.47
TY1A-DR3Q12441 SEC17YBL050W 879 nt5.89□□□□□ -1.47
TY1A-DR3Q12441 YNR021WYNR021W 1215 nt5.89□□□□□ -1.47
TY1A-DR3Q12441 DDP1YOR163W 567 nt5.89□□□□□ -1.47
TY1A-DR3Q12441 YOR248WYOR248W 303 nt5.89□□□□□ -1.47
TY1A-DR3Q12441 ARL1YBR164C 552 nt5.89□□□□□ -1.47
TY1A-DR3Q12441 ESC8YOL017W 2145 nt5.89□□□□□ -1.47
TY1A-DR3Q12441 YIL067CYIL067C 2037 nt5.88□□□□□ -1.47
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