Protein–RNA interactions for Protein: Q06625

GDB1, Glycogen debranching enzyme, yeastyeast

Predictions only

Length 1,536 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GDB1Q06625 FAD1YDL045C 921 nt4.98□□□□□ -1.61
GDB1Q06625 tF(GAA)DtF(GAA)D 73 nt4.98□□□□□ -1.61
GDB1Q06625 tF(GAA)NtF(GAA)N 73 nt4.98□□□□□ -1.61
GDB1Q06625 MCK1YNL307C 1128 nt4.98□□□□□ -1.61
GDB1Q06625 YPL113CYPL113C 1191 nt4.98□□□□□ -1.61
GDB1Q06625 IRC9YJL142C 393 nt4.97□□□□□ -1.61
GDB1Q06625 EXO5YBR163W 1758 nt4.97□□□□□ -1.61
GDB1Q06625 TAF8YML114C 1533 nt4.97□□□□□ -1.61
GDB1Q06625 TED1YIL039W 1422 nt4.97□□□□□ -1.61
GDB1Q06625 NKP1YDR383C 717 nt4.97□□□□□ -1.61
GDB1Q06625 PPX1YHR201C 1194 nt4.97□□□□□ -1.61
GDB1Q06625 USB1YLR132C 873 nt4.97□□□□□ -1.61
GDB1Q06625 ECM21YBL101C 3354 nt4.97□□□□□ -1.61
GDB1Q06625 IME4YGL192W 1803 nt4.96□□□□□ -1.61
GDB1Q06625 AVT1YJR001W 1809 nt4.96□□□□□ -1.61
GDB1Q06625 VHC1YBR235W 3363 nt4.96□□□□□ -1.62
GDB1Q06625 RPB2YOR151C 3675 nt4.95□□□□□ -1.62
GDB1Q06625 HGH1YGR187C 1185 nt4.95□□□□□ -1.62
GDB1Q06625 HOM3YER052C 1584 nt4.95□□□□□ -1.62
GDB1Q06625 ECM22YLR228C 2445 nt4.95□□□□□ -1.62
GDB1Q06625 ARG5,6YER069W 2592 nt4.94□□□□□ -1.62
GDB1Q06625 BUD27YFL023W 2391 nt4.94□□□□□ -1.62
GDB1Q06625 YHL049CYHL049C 816 nt4.94□□□□□ -1.62
GDB1Q06625 RIM9YMR063W 720 nt4.94□□□□□ -1.62
GDB1Q06625 UTP23YOR004W 765 nt4.94□□□□□ -1.62
GDB1Q06625 COS8YHL048W 1146 nt4.93□□□□□ -1.62
GDB1Q06625 NIP7YPL211W 546 nt4.93□□□□□ -1.62
GDB1Q06625 STR2YJR130C 1920 nt4.93□□□□□ -1.62
GDB1Q06625 YJR128WYJR128W 360 nt4.92□□□□□ -1.62
GDB1Q06625 YPT7YML001W 627 nt4.92□□□□□ -1.62
GDB1Q06625 MRPL16YBL038W 699 nt4.92□□□□□ -1.62
GDB1Q06625 MED4YOR174W 855 nt4.92□□□□□ -1.62
GDB1Q06625 MET10YFR030W 3108 nt4.92□□□□□ -1.62
GDB1Q06625 YJL175WYJL175W 513 nt4.92□□□□□ -1.62
GDB1Q06625 HOT1YMR172W 2160 nt4.91□□□□□ -1.62
GDB1Q06625 FAS2YPL231W 5664 nt4.91□□□□□ -1.62
GDB1Q06625 MRH1YDR033W 963 nt4.91□□□□□ -1.62
GDB1Q06625 SPT15YER148W 723 nt4.91□□□□□ -1.62
GDB1Q06625 CDC26YFR036W 375 nt4.91□□□□□ -1.62
GDB1Q06625 RAI1YGL246C 1164 nt4.91□□□□□ -1.62
GDB1Q06625 MOT2YER068W 1764 nt4.91□□□□□ -1.62
GDB1Q06625 EMP70YLR083C 2004 nt4.91□□□□□ -1.62
GDB1Q06625 YOR387CYOR387C 621 nt4.9□□□□□ -1.63
GDB1Q06625 GAL11YOL051W 3246 nt4.9□□□□□ -1.63
GDB1Q06625 ELM1YKL048C 1923 nt4.9□□□□□ -1.63
GDB1Q06625 SHO1YER118C 1104 nt4.89□□□□□ -1.63
GDB1Q06625 MLH2YLR035C 2088 nt4.89□□□□□ -1.63
GDB1Q06625 CMR1YDL156W 1569 nt4.89□□□□□ -1.63
GDB1Q06625 GSC2YGR032W 5688 nt4.88□□□□□ -1.63
GDB1Q06625 NOP7YGR103W 1818 nt4.88□□□□□ -1.63
GDB1Q06625 tK(UUU)DtK(UUU)D 73 nt4.88□□□□□ -1.63
GDB1Q06625 tK(UUU)G1tK(UUU)G1 73 nt4.88□□□□□ -1.63
GDB1Q06625 tK(UUU)G2tK(UUU)G2 73 nt4.88□□□□□ -1.63
GDB1Q06625 tK(UUU)KtK(UUU)K 73 nt4.88□□□□□ -1.63
GDB1Q06625 tK(UUU)LtK(UUU)L 73 nt4.88□□□□□ -1.63
GDB1Q06625 tK(UUU)OtK(UUU)O 73 nt4.88□□□□□ -1.63
GDB1Q06625 tK(UUU)PtK(UUU)P 73 nt4.88□□□□□ -1.63
GDB1Q06625 PRE4YFR050C 801 nt4.88□□□□□ -1.63
GDB1Q06625 TOM7YNL070W 183 nt4.88□□□□□ -1.63
GDB1Q06625 UTP9YHR196W 1728 nt4.88□□□□□ -1.63
GDB1Q06625 YFL052WYFL052W 1398 nt4.88□□□□□ -1.63
GDB1Q06625 RAD53YPL153C 2466 nt4.88□□□□□ -1.63
GDB1Q06625 RHO3YIL118W 696 nt4.87□□□□□ -1.63
GDB1Q06625 MAK16YAL025C 921 nt4.87□□□□□ -1.63
GDB1Q06625 YML020WYML020W 1995 nt4.87□□□□□ -1.63
GDB1Q06625 PAN5YHR063C 1140 nt4.87□□□□□ -1.63
GDB1Q06625 STI1YOR027W 1770 nt4.86□□□□□ -1.63
GDB1Q06625 AIM17YHL021C 1398 nt4.86□□□□□ -1.63
GDB1Q06625 YLR156WYLR156W 345 nt4.86□□□□□ -1.63
GDB1Q06625 YLR159WYLR159W 345 nt4.86□□□□□ -1.63
GDB1Q06625 YLR161WYLR161W 345 nt4.86□□□□□ -1.63
GDB1Q06625 HAL5YJL165C 2568 nt4.85□□□□□ -1.63
GDB1Q06625 YER084WYER084W 387 nt4.85□□□□□ -1.63
GDB1Q06625 SOP4YJL192C 705 nt4.85□□□□□ -1.63
GDB1Q06625 snR42snR42 351 nt4.85□□□□□ -1.63
GDB1Q06625 YMR317WYMR317W 3423 nt4.85□□□□□ -1.63
GDB1Q06625 SYT1YPR095C 3681 nt4.84□□□□□ -1.63
GDB1Q06625 HCA4YJL033W 2313 nt4.84□□□□□ -1.63
GDB1Q06625 MDM12YOL009C 816 nt4.84□□□□□ -1.63
GDB1Q06625 TGS1YPL157W 948 nt4.84□□□□□ -1.63
GDB1Q06625 MEC3YLR288C 1425 nt4.84□□□□□ -1.63
GDB1Q06625 DRS2YAL026C 4068 nt4.84□□□□□ -1.64
GDB1Q06625 OMS1YDR316W 1416 nt4.83□□□□□ -1.64
GDB1Q06625 MRP13YGR084C 1020 nt4.83□□□□□ -1.64
GDB1Q06625 BIO2YGR286C 1128 nt4.83□□□□□ -1.64
GDB1Q06625 PFK26YIL107C 2484 nt4.83□□□□□ -1.64
GDB1Q06625 MED7YOL135C 669 nt4.83□□□□□ -1.64
GDB1Q06625 YKL050CYKL050C 2769 nt4.83□□□□□ -1.64
GDB1Q06625 RPL8BYLL045C 771 nt4.82□□□□□ -1.64
GDB1Q06625 NAT3YPR131C 588 nt4.82□□□□□ -1.64
GDB1Q06625 UBP13YBL067C 2244 nt4.82□□□□□ -1.64
GDB1Q06625 NOP4YPL043W 2058 nt4.82□□□□□ -1.64
GDB1Q06625 COX14YML129C 213 nt4.82□□□□□ -1.64
GDB1Q06625 YLH47YPR125W 1365 nt4.81□□□□□ -1.64
GDB1Q06625 YPK9YOR291W 4419 nt4.81□□□□□ -1.64
GDB1Q06625 BMH2YDR099W 822 nt4.81□□□□□ -1.64
GDB1Q06625 RPS8BYER102W 603 nt4.81□□□□□ -1.64
GDB1Q06625 RPS8AYBL072C 603 nt4.81□□□□□ -1.64
GDB1Q06625 INN1YNL152W 1230 nt4.81□□□□□ -1.64
GDB1Q06625 PRP9YDL030W 1593 nt4.81□□□□□ -1.64
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