Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Cxcr5Q04683 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cxcr5Q04683 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cxcr5Q04683 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cxcr5Q04683 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cxcr5Q04683 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cxcr5Q04683 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cxcr5Q04683 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cxcr5Q04683 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cxcr5Q04683 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cxcr5Q04683 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cxcr5Q04683 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cxcr5Q04683 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cxcr5Q04683 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cxcr5Q04683 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cxcr5Q04683 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cxcr5Q04683 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cxcr5Q04683 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Cxcr5Q04683 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cxcr5Q04683 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cxcr5Q04683 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cxcr5Q04683 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cxcr5Q04683 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cxcr5Q04683 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cxcr5Q04683 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cxcr5Q04683 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cxcr5Q04683 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cxcr5Q04683 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cxcr5Q04683 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cxcr5Q04683 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cxcr5Q04683 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cxcr5Q04683 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cxcr5Q04683 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cxcr5Q04683 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cxcr5Q04683 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cxcr5Q04683 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cxcr5Q04683 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cxcr5Q04683 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cxcr5Q04683 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cxcr5Q04683 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cxcr5Q04683 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cxcr5Q04683 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cxcr5Q04683 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cxcr5Q04683 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cxcr5Q04683 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cxcr5Q04683 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cxcr5Q04683 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cxcr5Q04683 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cxcr5Q04683 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cxcr5Q04683 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cxcr5Q04683 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cxcr5Q04683 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cxcr5Q04683 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cxcr5Q04683 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cxcr5Q04683 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cxcr5Q04683 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Cxcr5Q04683 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cxcr5Q04683 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cxcr5Q04683 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cxcr5Q04683 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Cxcr5Q04683 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cxcr5Q04683 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Cxcr5Q04683 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cxcr5Q04683 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cxcr5Q04683 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cxcr5Q04683 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cxcr5Q04683 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cxcr5Q04683 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cxcr5Q04683 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cxcr5Q04683 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cxcr5Q04683 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cxcr5Q04683 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cxcr5Q04683 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cxcr5Q04683 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cxcr5Q04683 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cxcr5Q04683 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cxcr5Q04683 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cxcr5Q04683 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cxcr5Q04683 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cxcr5Q04683 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cxcr5Q04683 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cxcr5Q04683 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cxcr5Q04683 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cxcr5Q04683 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cxcr5Q04683 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cxcr5Q04683 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cxcr5Q04683 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cxcr5Q04683 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cxcr5Q04683 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cxcr5Q04683 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cxcr5Q04683 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cxcr5Q04683 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cxcr5Q04683 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cxcr5Q04683 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cxcr5Q04683 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cxcr5Q04683 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cxcr5Q04683 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cxcr5Q04683 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cxcr5Q04683 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cxcr5Q04683 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms