Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Msx2Q03358 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Msx2Q03358 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Msx2Q03358 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Msx2Q03358 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Msx2Q03358 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Msx2Q03358 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Msx2Q03358 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Msx2Q03358 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Msx2Q03358 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Msx2Q03358 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Msx2Q03358 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Msx2Q03358 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Msx2Q03358 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Msx2Q03358 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Msx2Q03358 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Msx2Q03358 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Msx2Q03358 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Msx2Q03358 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Msx2Q03358 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Msx2Q03358 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Msx2Q03358 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Msx2Q03358 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Msx2Q03358 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Msx2Q03358 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Msx2Q03358 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Msx2Q03358 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Msx2Q03358 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Msx2Q03358 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Msx2Q03358 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Msx2Q03358 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Msx2Q03358 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Msx2Q03358 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Msx2Q03358 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Msx2Q03358 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Msx2Q03358 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Msx2Q03358 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Msx2Q03358 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Msx2Q03358 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Msx2Q03358 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Msx2Q03358 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Msx2Q03358 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Msx2Q03358 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Msx2Q03358 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Msx2Q03358 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Msx2Q03358 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Msx2Q03358 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Msx2Q03358 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Msx2Q03358 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Msx2Q03358 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Msx2Q03358 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Msx2Q03358 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Msx2Q03358 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Msx2Q03358 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Msx2Q03358 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Msx2Q03358 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Msx2Q03358 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Msx2Q03358 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Msx2Q03358 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Msx2Q03358 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Msx2Q03358 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Msx2Q03358 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Msx2Q03358 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Msx2Q03358 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Msx2Q03358 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Msx2Q03358 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Msx2Q03358 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Msx2Q03358 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Msx2Q03358 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Msx2Q03358 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Msx2Q03358 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Msx2Q03358 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Msx2Q03358 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Msx2Q03358 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Msx2Q03358 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Msx2Q03358 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Msx2Q03358 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Msx2Q03358 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Msx2Q03358 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Msx2Q03358 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Msx2Q03358 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Msx2Q03358 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Msx2Q03358 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Msx2Q03358 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Msx2Q03358 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Msx2Q03358 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Msx2Q03358 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Msx2Q03358 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Msx2Q03358 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Msx2Q03358 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Msx2Q03358 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Msx2Q03358 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Msx2Q03358 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Msx2Q03358 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Msx2Q03358 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Msx2Q03358 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Msx2Q03358 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Msx2Q03358 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Msx2Q03358 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Msx2Q03358 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms