Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNTN2Q02246 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNTN2Q02246 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNTN2Q02246 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNTN2Q02246 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNTN2Q02246 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNTN2Q02246 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNTN2Q02246 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNTN2Q02246 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNTN2Q02246 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNTN2Q02246 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNTN2Q02246 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNTN2Q02246 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNTN2Q02246 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNTN2Q02246 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNTN2Q02246 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNTN2Q02246 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNTN2Q02246 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNTN2Q02246 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNTN2Q02246 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNTN2Q02246 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNTN2Q02246 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNTN2Q02246 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNTN2Q02246 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CNTN2Q02246 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNTN2Q02246 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNTN2Q02246 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNTN2Q02246 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNTN2Q02246 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNTN2Q02246 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNTN2Q02246 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNTN2Q02246 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNTN2Q02246 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNTN2Q02246 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNTN2Q02246 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNTN2Q02246 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNTN2Q02246 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNTN2Q02246 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNTN2Q02246 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CNTN2Q02246 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNTN2Q02246 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNTN2Q02246 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CNTN2Q02246 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNTN2Q02246 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNTN2Q02246 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CNTN2Q02246 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CNTN2Q02246 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNTN2Q02246 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNTN2Q02246 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNTN2Q02246 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CNTN2Q02246 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CNTN2Q02246 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNTN2Q02246 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNTN2Q02246 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNTN2Q02246 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNTN2Q02246 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNTN2Q02246 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNTN2Q02246 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNTN2Q02246 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNTN2Q02246 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CNTN2Q02246 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CNTN2Q02246 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNTN2Q02246 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNTN2Q02246 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNTN2Q02246 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNTN2Q02246 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNTN2Q02246 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNTN2Q02246 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNTN2Q02246 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CNTN2Q02246 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNTN2Q02246 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNTN2Q02246 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNTN2Q02246 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
CNTN2Q02246 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNTN2Q02246 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNTN2Q02246 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNTN2Q02246 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNTN2Q02246 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNTN2Q02246 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNTN2Q02246 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CNTN2Q02246 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNTN2Q02246 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNTN2Q02246 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNTN2Q02246 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNTN2Q02246 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNTN2Q02246 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNTN2Q02246 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNTN2Q02246 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNTN2Q02246 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNTN2Q02246 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNTN2Q02246 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNTN2Q02246 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNTN2Q02246 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNTN2Q02246 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNTN2Q02246 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNTN2Q02246 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNTN2Q02246 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNTN2Q02246 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNTN2Q02246 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNTN2Q02246 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms