Protein–RNA interactions for Protein: Q02013

Aqp1, Aquaporin-1, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp1Q02013 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Aqp1Q02013 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Aqp1Q02013 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Aqp1Q02013 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Aqp1Q02013 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Aqp1Q02013 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Aqp1Q02013 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Aqp1Q02013 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Aqp1Q02013 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Aqp1Q02013 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Aqp1Q02013 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Aqp1Q02013 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Aqp1Q02013 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Aqp1Q02013 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Aqp1Q02013 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Aqp1Q02013 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Aqp1Q02013 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Aqp1Q02013 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Aqp1Q02013 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Aqp1Q02013 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Aqp1Q02013 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Aqp1Q02013 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Aqp1Q02013 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Aqp1Q02013 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Aqp1Q02013 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Aqp1Q02013 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Aqp1Q02013 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Aqp1Q02013 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Aqp1Q02013 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Aqp1Q02013 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Aqp1Q02013 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Aqp1Q02013 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Aqp1Q02013 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Aqp1Q02013 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Aqp1Q02013 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Aqp1Q02013 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Aqp1Q02013 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Aqp1Q02013 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Aqp1Q02013 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Aqp1Q02013 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Aqp1Q02013 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Aqp1Q02013 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Aqp1Q02013 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Aqp1Q02013 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Aqp1Q02013 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Aqp1Q02013 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Aqp1Q02013 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Aqp1Q02013 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Aqp1Q02013 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Aqp1Q02013 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Aqp1Q02013 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Aqp1Q02013 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Aqp1Q02013 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Aqp1Q02013 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Aqp1Q02013 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Aqp1Q02013 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Aqp1Q02013 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Aqp1Q02013 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Aqp1Q02013 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Aqp1Q02013 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Aqp1Q02013 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Aqp1Q02013 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Aqp1Q02013 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Aqp1Q02013 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Aqp1Q02013 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Aqp1Q02013 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Aqp1Q02013 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Aqp1Q02013 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Aqp1Q02013 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Aqp1Q02013 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Aqp1Q02013 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Aqp1Q02013 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Aqp1Q02013 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Aqp1Q02013 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Aqp1Q02013 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Aqp1Q02013 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Aqp1Q02013 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Aqp1Q02013 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Aqp1Q02013 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Aqp1Q02013 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Aqp1Q02013 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Aqp1Q02013 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Aqp1Q02013 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Aqp1Q02013 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Aqp1Q02013 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Aqp1Q02013 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Aqp1Q02013 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Aqp1Q02013 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Aqp1Q02013 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Aqp1Q02013 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Aqp1Q02013 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Aqp1Q02013 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Aqp1Q02013 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Aqp1Q02013 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Aqp1Q02013 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Aqp1Q02013 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Aqp1Q02013 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Aqp1Q02013 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Aqp1Q02013 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Aqp1Q02013 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms