Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
VcpQ01853 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VcpQ01853 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VcpQ01853 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
VcpQ01853 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
VcpQ01853 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
VcpQ01853 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VcpQ01853 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VcpQ01853 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VcpQ01853 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VcpQ01853 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VcpQ01853 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VcpQ01853 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
VcpQ01853 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VcpQ01853 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VcpQ01853 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VcpQ01853 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VcpQ01853 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VcpQ01853 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VcpQ01853 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VcpQ01853 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
VcpQ01853 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VcpQ01853 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
VcpQ01853 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
VcpQ01853 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
VcpQ01853 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
VcpQ01853 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
VcpQ01853 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
VcpQ01853 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
VcpQ01853 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
VcpQ01853 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21■□□□□ 0.95
VcpQ01853 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
VcpQ01853 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
VcpQ01853 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
VcpQ01853 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
VcpQ01853 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
VcpQ01853 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
VcpQ01853 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
VcpQ01853 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VcpQ01853 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
VcpQ01853 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
VcpQ01853 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
VcpQ01853 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VcpQ01853 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VcpQ01853 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VcpQ01853 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
VcpQ01853 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
VcpQ01853 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
VcpQ01853 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
VcpQ01853 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
VcpQ01853 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
VcpQ01853 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
VcpQ01853 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
VcpQ01853 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
VcpQ01853 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
VcpQ01853 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
VcpQ01853 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
VcpQ01853 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
VcpQ01853 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
VcpQ01853 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
VcpQ01853 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
VcpQ01853 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
VcpQ01853 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
VcpQ01853 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
VcpQ01853 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
VcpQ01853 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
VcpQ01853 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
VcpQ01853 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VcpQ01853 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VcpQ01853 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
VcpQ01853 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VcpQ01853 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VcpQ01853 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VcpQ01853 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VcpQ01853 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VcpQ01853 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VcpQ01853 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
VcpQ01853 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
VcpQ01853 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
VcpQ01853 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VcpQ01853 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VcpQ01853 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VcpQ01853 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VcpQ01853 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
VcpQ01853 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
VcpQ01853 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
VcpQ01853 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
VcpQ01853 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
VcpQ01853 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
VcpQ01853 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
VcpQ01853 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
VcpQ01853 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
VcpQ01853 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
VcpQ01853 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
VcpQ01853 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
VcpQ01853 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
VcpQ01853 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
VcpQ01853 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
VcpQ01853 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
VcpQ01853 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms