Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gja5Q01231 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gja5Q01231 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gja5Q01231 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Gja5Q01231 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gja5Q01231 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gja5Q01231 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gja5Q01231 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Gja5Q01231 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Gja5Q01231 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Gja5Q01231 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Gja5Q01231 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Gja5Q01231 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Gja5Q01231 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Gja5Q01231 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gja5Q01231 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gja5Q01231 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gja5Q01231 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gja5Q01231 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Gja5Q01231 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gja5Q01231 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gja5Q01231 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gja5Q01231 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gja5Q01231 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gja5Q01231 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gja5Q01231 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gja5Q01231 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gja5Q01231 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gja5Q01231 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gja5Q01231 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gja5Q01231 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Gja5Q01231 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gja5Q01231 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gja5Q01231 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gja5Q01231 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gja5Q01231 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gja5Q01231 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gja5Q01231 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Gja5Q01231 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gja5Q01231 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Gja5Q01231 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gja5Q01231 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gja5Q01231 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gja5Q01231 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gja5Q01231 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gja5Q01231 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gja5Q01231 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gja5Q01231 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gja5Q01231 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gja5Q01231 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gja5Q01231 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gja5Q01231 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gja5Q01231 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gja5Q01231 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gja5Q01231 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gja5Q01231 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gja5Q01231 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gja5Q01231 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gja5Q01231 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gja5Q01231 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gja5Q01231 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gja5Q01231 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gja5Q01231 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gja5Q01231 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gja5Q01231 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Gja5Q01231 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gja5Q01231 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gja5Q01231 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gja5Q01231 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gja5Q01231 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gja5Q01231 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gja5Q01231 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gja5Q01231 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gja5Q01231 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gja5Q01231 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gja5Q01231 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gja5Q01231 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Gja5Q01231 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gja5Q01231 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gja5Q01231 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Gja5Q01231 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gja5Q01231 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gja5Q01231 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gja5Q01231 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gja5Q01231 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gja5Q01231 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Gja5Q01231 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gja5Q01231 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gja5Q01231 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gja5Q01231 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gja5Q01231 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gja5Q01231 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gja5Q01231 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Gja5Q01231 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gja5Q01231 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gja5Q01231 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gja5Q01231 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gja5Q01231 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gja5Q01231 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gja5Q01231 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms