Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Col1a2Q01149 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Col1a2Q01149 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Col1a2Q01149 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Col1a2Q01149 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Col1a2Q01149 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Col1a2Q01149 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Col1a2Q01149 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Col1a2Q01149 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Col1a2Q01149 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Col1a2Q01149 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Col1a2Q01149 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Col1a2Q01149 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Col1a2Q01149 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Col1a2Q01149 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Col1a2Q01149 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Col1a2Q01149 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Col1a2Q01149 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Col1a2Q01149 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Col1a2Q01149 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Col1a2Q01149 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Col1a2Q01149 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Col1a2Q01149 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Col1a2Q01149 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Col1a2Q01149 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Col1a2Q01149 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Col1a2Q01149 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Col1a2Q01149 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Col1a2Q01149 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Col1a2Q01149 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Col1a2Q01149 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Col1a2Q01149 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Col1a2Q01149 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Col1a2Q01149 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Col1a2Q01149 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Col1a2Q01149 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Col1a2Q01149 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Col1a2Q01149 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Col1a2Q01149 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Col1a2Q01149 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Col1a2Q01149 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Col1a2Q01149 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Col1a2Q01149 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Col1a2Q01149 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Col1a2Q01149 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Col1a2Q01149 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Col1a2Q01149 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Col1a2Q01149 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Col1a2Q01149 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Col1a2Q01149 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Col1a2Q01149 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Col1a2Q01149 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Col1a2Q01149 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Col1a2Q01149 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Col1a2Q01149 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Col1a2Q01149 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Col1a2Q01149 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Col1a2Q01149 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Col1a2Q01149 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Col1a2Q01149 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Col1a2Q01149 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Col1a2Q01149 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Col1a2Q01149 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Col1a2Q01149 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Col1a2Q01149 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Col1a2Q01149 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Col1a2Q01149 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Col1a2Q01149 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Col1a2Q01149 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Col1a2Q01149 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Col1a2Q01149 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Col1a2Q01149 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Col1a2Q01149 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Col1a2Q01149 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Col1a2Q01149 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Col1a2Q01149 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Col1a2Q01149 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Col1a2Q01149 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Col1a2Q01149 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Col1a2Q01149 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Col1a2Q01149 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Col1a2Q01149 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Col1a2Q01149 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Col1a2Q01149 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Col1a2Q01149 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Col1a2Q01149 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Col1a2Q01149 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Col1a2Q01149 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Col1a2Q01149 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Col1a2Q01149 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Col1a2Q01149 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Col1a2Q01149 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Col1a2Q01149 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Col1a2Q01149 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Col1a2Q01149 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Col1a2Q01149 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Col1a2Q01149 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Col1a2Q01149 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Col1a2Q01149 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Col1a2Q01149 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms