Protein–RNA interactions for Protein: P70278

Stra8, Stimulated by retinoic acid gene 8 protein, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra8P70278 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Stra8P70278 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Stra8P70278 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Stra8P70278 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Stra8P70278 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Stra8P70278 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Stra8P70278 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Stra8P70278 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Stra8P70278 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Stra8P70278 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Stra8P70278 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Stra8P70278 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Stra8P70278 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Stra8P70278 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Stra8P70278 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Stra8P70278 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Stra8P70278 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Stra8P70278 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Stra8P70278 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Stra8P70278 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Stra8P70278 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Stra8P70278 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Stra8P70278 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Stra8P70278 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Stra8P70278 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Stra8P70278 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Stra8P70278 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Stra8P70278 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Stra8P70278 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Stra8P70278 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Stra8P70278 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Stra8P70278 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Stra8P70278 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Stra8P70278 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Stra8P70278 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Stra8P70278 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Stra8P70278 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Stra8P70278 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Stra8P70278 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Stra8P70278 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Stra8P70278 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Stra8P70278 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Stra8P70278 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Stra8P70278 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Stra8P70278 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Stra8P70278 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Stra8P70278 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Stra8P70278 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Stra8P70278 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Stra8P70278 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Stra8P70278 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Stra8P70278 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Stra8P70278 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Stra8P70278 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Stra8P70278 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Stra8P70278 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Stra8P70278 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Stra8P70278 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Stra8P70278 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Stra8P70278 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Stra8P70278 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Stra8P70278 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Stra8P70278 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Stra8P70278 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Stra8P70278 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Stra8P70278 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Stra8P70278 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Stra8P70278 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Stra8P70278 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Stra8P70278 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Stra8P70278 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Stra8P70278 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Stra8P70278 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Stra8P70278 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Stra8P70278 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Stra8P70278 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Stra8P70278 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Stra8P70278 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Stra8P70278 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Stra8P70278 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Stra8P70278 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Stra8P70278 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Stra8P70278 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Stra8P70278 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Stra8P70278 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Stra8P70278 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Stra8P70278 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Stra8P70278 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Stra8P70278 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Stra8P70278 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Stra8P70278 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Stra8P70278 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Stra8P70278 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Stra8P70278 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Stra8P70278 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Stra8P70278 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
Stra8P70278 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
Stra8P70278 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Stra8P70278 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Stra8P70278 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms