Protein–RNA interactions for Protein: P63254

Crip1, Cysteine-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crip1P63254 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crip1P63254 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crip1P63254 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Crip1P63254 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crip1P63254 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crip1P63254 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crip1P63254 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crip1P63254 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crip1P63254 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crip1P63254 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crip1P63254 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crip1P63254 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crip1P63254 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crip1P63254 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crip1P63254 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crip1P63254 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crip1P63254 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crip1P63254 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crip1P63254 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crip1P63254 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crip1P63254 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crip1P63254 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Crip1P63254 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crip1P63254 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crip1P63254 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crip1P63254 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crip1P63254 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crip1P63254 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crip1P63254 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crip1P63254 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crip1P63254 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crip1P63254 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crip1P63254 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crip1P63254 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crip1P63254 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crip1P63254 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crip1P63254 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crip1P63254 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crip1P63254 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crip1P63254 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crip1P63254 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crip1P63254 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crip1P63254 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crip1P63254 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Crip1P63254 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Crip1P63254 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Crip1P63254 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Crip1P63254 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Crip1P63254 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Crip1P63254 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Crip1P63254 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Crip1P63254 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Crip1P63254 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Crip1P63254 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Crip1P63254 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Crip1P63254 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Crip1P63254 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Crip1P63254 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Crip1P63254 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Crip1P63254 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Crip1P63254 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Crip1P63254 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Crip1P63254 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Crip1P63254 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Crip1P63254 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Crip1P63254 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Crip1P63254 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Crip1P63254 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Crip1P63254 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Crip1P63254 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Crip1P63254 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Crip1P63254 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Crip1P63254 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Crip1P63254 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Crip1P63254 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Crip1P63254 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Crip1P63254 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Crip1P63254 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Crip1P63254 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Crip1P63254 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Crip1P63254 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Crip1P63254 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Crip1P63254 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Crip1P63254 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Crip1P63254 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Crip1P63254 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Crip1P63254 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Crip1P63254 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Crip1P63254 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Crip1P63254 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Crip1P63254 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Crip1P63254 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Crip1P63254 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Crip1P63254 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Crip1P63254 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Crip1P63254 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Crip1P63254 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Crip1P63254 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Crip1P63254 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Crip1P63254 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms