Protein–RNA interactions for Protein: P63166

Sumo1, Small ubiquitin-related modifier 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumo1P63166 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sumo1P63166 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sumo1P63166 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sumo1P63166 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sumo1P63166 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sumo1P63166 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sumo1P63166 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sumo1P63166 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sumo1P63166 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sumo1P63166 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sumo1P63166 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sumo1P63166 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sumo1P63166 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sumo1P63166 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sumo1P63166 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sumo1P63166 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sumo1P63166 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sumo1P63166 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sumo1P63166 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sumo1P63166 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sumo1P63166 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sumo1P63166 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sumo1P63166 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sumo1P63166 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sumo1P63166 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sumo1P63166 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sumo1P63166 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sumo1P63166 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sumo1P63166 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sumo1P63166 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sumo1P63166 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sumo1P63166 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sumo1P63166 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sumo1P63166 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sumo1P63166 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sumo1P63166 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sumo1P63166 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sumo1P63166 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sumo1P63166 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sumo1P63166 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sumo1P63166 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sumo1P63166 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sumo1P63166 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sumo1P63166 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sumo1P63166 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sumo1P63166 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sumo1P63166 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sumo1P63166 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sumo1P63166 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sumo1P63166 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sumo1P63166 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sumo1P63166 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sumo1P63166 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sumo1P63166 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sumo1P63166 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sumo1P63166 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sumo1P63166 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sumo1P63166 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sumo1P63166 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sumo1P63166 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sumo1P63166 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sumo1P63166 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sumo1P63166 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sumo1P63166 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sumo1P63166 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sumo1P63166 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sumo1P63166 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sumo1P63166 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sumo1P63166 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sumo1P63166 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sumo1P63166 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sumo1P63166 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sumo1P63166 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sumo1P63166 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sumo1P63166 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sumo1P63166 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sumo1P63166 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sumo1P63166 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sumo1P63166 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sumo1P63166 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sumo1P63166 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sumo1P63166 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sumo1P63166 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sumo1P63166 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sumo1P63166 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sumo1P63166 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sumo1P63166 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sumo1P63166 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sumo1P63166 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sumo1P63166 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sumo1P63166 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sumo1P63166 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sumo1P63166 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sumo1P63166 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sumo1P63166 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sumo1P63166 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sumo1P63166 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sumo1P63166 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sumo1P63166 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sumo1P63166 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms