Protein–RNA interactions for Protein: P63028

Tpt1, Translationally-controlled tumor protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpt1P63028 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpt1P63028 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpt1P63028 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpt1P63028 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpt1P63028 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpt1P63028 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpt1P63028 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpt1P63028 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpt1P63028 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpt1P63028 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpt1P63028 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpt1P63028 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tpt1P63028 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tpt1P63028 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tpt1P63028 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tpt1P63028 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tpt1P63028 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tpt1P63028 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tpt1P63028 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpt1P63028 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpt1P63028 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpt1P63028 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpt1P63028 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpt1P63028 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpt1P63028 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpt1P63028 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpt1P63028 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpt1P63028 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpt1P63028 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpt1P63028 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpt1P63028 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpt1P63028 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpt1P63028 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpt1P63028 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpt1P63028 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpt1P63028 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpt1P63028 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpt1P63028 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpt1P63028 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpt1P63028 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpt1P63028 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpt1P63028 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpt1P63028 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpt1P63028 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpt1P63028 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpt1P63028 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpt1P63028 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpt1P63028 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpt1P63028 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpt1P63028 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpt1P63028 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpt1P63028 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpt1P63028 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpt1P63028 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpt1P63028 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpt1P63028 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpt1P63028 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpt1P63028 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpt1P63028 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpt1P63028 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpt1P63028 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpt1P63028 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpt1P63028 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpt1P63028 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpt1P63028 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpt1P63028 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpt1P63028 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpt1P63028 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpt1P63028 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpt1P63028 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpt1P63028 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpt1P63028 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpt1P63028 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpt1P63028 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpt1P63028 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpt1P63028 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpt1P63028 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpt1P63028 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpt1P63028 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpt1P63028 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpt1P63028 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpt1P63028 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpt1P63028 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpt1P63028 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpt1P63028 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpt1P63028 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpt1P63028 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpt1P63028 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpt1P63028 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpt1P63028 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpt1P63028 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpt1P63028 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpt1P63028 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpt1P63028 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpt1P63028 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpt1P63028 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpt1P63028 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpt1P63028 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpt1P63028 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpt1P63028 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms