Protein–RNA interactions for Protein: P62874

Gnb1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnb1P62874 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gnb1P62874 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gnb1P62874 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gnb1P62874 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gnb1P62874 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gnb1P62874 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gnb1P62874 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gnb1P62874 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gnb1P62874 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gnb1P62874 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gnb1P62874 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gnb1P62874 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gnb1P62874 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gnb1P62874 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gnb1P62874 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gnb1P62874 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gnb1P62874 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gnb1P62874 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gnb1P62874 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gnb1P62874 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gnb1P62874 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gnb1P62874 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gnb1P62874 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gnb1P62874 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gnb1P62874 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gnb1P62874 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gnb1P62874 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gnb1P62874 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gnb1P62874 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gnb1P62874 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gnb1P62874 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gnb1P62874 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gnb1P62874 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gnb1P62874 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gnb1P62874 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gnb1P62874 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gnb1P62874 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gnb1P62874 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gnb1P62874 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gnb1P62874 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gnb1P62874 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gnb1P62874 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gnb1P62874 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gnb1P62874 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gnb1P62874 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gnb1P62874 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gnb1P62874 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gnb1P62874 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gnb1P62874 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gnb1P62874 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gnb1P62874 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gnb1P62874 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gnb1P62874 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gnb1P62874 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gnb1P62874 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gnb1P62874 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gnb1P62874 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gnb1P62874 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gnb1P62874 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gnb1P62874 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gnb1P62874 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gnb1P62874 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gnb1P62874 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gnb1P62874 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gnb1P62874 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gnb1P62874 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gnb1P62874 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gnb1P62874 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gnb1P62874 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gnb1P62874 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gnb1P62874 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gnb1P62874 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gnb1P62874 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gnb1P62874 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gnb1P62874 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gnb1P62874 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gnb1P62874 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gnb1P62874 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gnb1P62874 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gnb1P62874 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gnb1P62874 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gnb1P62874 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gnb1P62874 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gnb1P62874 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gnb1P62874 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gnb1P62874 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gnb1P62874 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gnb1P62874 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gnb1P62874 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gnb1P62874 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gnb1P62874 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gnb1P62874 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gnb1P62874 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gnb1P62874 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gnb1P62874 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gnb1P62874 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gnb1P62874 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gnb1P62874 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gnb1P62874 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gnb1P62874 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms