Protein–RNA interactions for Protein: P62823

Rab3c, Ras-related protein Rab-3C, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3cP62823 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab3cP62823 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab3cP62823 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab3cP62823 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab3cP62823 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab3cP62823 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab3cP62823 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab3cP62823 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab3cP62823 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab3cP62823 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab3cP62823 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab3cP62823 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab3cP62823 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab3cP62823 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab3cP62823 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab3cP62823 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab3cP62823 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab3cP62823 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab3cP62823 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab3cP62823 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab3cP62823 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab3cP62823 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab3cP62823 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab3cP62823 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab3cP62823 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab3cP62823 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab3cP62823 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab3cP62823 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab3cP62823 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab3cP62823 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab3cP62823 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab3cP62823 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab3cP62823 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab3cP62823 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab3cP62823 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab3cP62823 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab3cP62823 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab3cP62823 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab3cP62823 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab3cP62823 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab3cP62823 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab3cP62823 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab3cP62823 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab3cP62823 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab3cP62823 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab3cP62823 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab3cP62823 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab3cP62823 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab3cP62823 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab3cP62823 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab3cP62823 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab3cP62823 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab3cP62823 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab3cP62823 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab3cP62823 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab3cP62823 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab3cP62823 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab3cP62823 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab3cP62823 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab3cP62823 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab3cP62823 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab3cP62823 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab3cP62823 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab3cP62823 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab3cP62823 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab3cP62823 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab3cP62823 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab3cP62823 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab3cP62823 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab3cP62823 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab3cP62823 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab3cP62823 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab3cP62823 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab3cP62823 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab3cP62823 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab3cP62823 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab3cP62823 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab3cP62823 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab3cP62823 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab3cP62823 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab3cP62823 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab3cP62823 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab3cP62823 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab3cP62823 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab3cP62823 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab3cP62823 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab3cP62823 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab3cP62823 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab3cP62823 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab3cP62823 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab3cP62823 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab3cP62823 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab3cP62823 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab3cP62823 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab3cP62823 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab3cP62823 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab3cP62823 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab3cP62823 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab3cP62823 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Rab3cP62823 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms