Protein–RNA interactions for Protein: P56371

Rab4a, Ras-related protein Rab-4A, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab4aP56371 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab4aP56371 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab4aP56371 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab4aP56371 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab4aP56371 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab4aP56371 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab4aP56371 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab4aP56371 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab4aP56371 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab4aP56371 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab4aP56371 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab4aP56371 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab4aP56371 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab4aP56371 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab4aP56371 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab4aP56371 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab4aP56371 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab4aP56371 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab4aP56371 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab4aP56371 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab4aP56371 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab4aP56371 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab4aP56371 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab4aP56371 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab4aP56371 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab4aP56371 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab4aP56371 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab4aP56371 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab4aP56371 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab4aP56371 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab4aP56371 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab4aP56371 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab4aP56371 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab4aP56371 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab4aP56371 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab4aP56371 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab4aP56371 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab4aP56371 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab4aP56371 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab4aP56371 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab4aP56371 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab4aP56371 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab4aP56371 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab4aP56371 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab4aP56371 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab4aP56371 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab4aP56371 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab4aP56371 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab4aP56371 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab4aP56371 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab4aP56371 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab4aP56371 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab4aP56371 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab4aP56371 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab4aP56371 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab4aP56371 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab4aP56371 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab4aP56371 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab4aP56371 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab4aP56371 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab4aP56371 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab4aP56371 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab4aP56371 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab4aP56371 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab4aP56371 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab4aP56371 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab4aP56371 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab4aP56371 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab4aP56371 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab4aP56371 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab4aP56371 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab4aP56371 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab4aP56371 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab4aP56371 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab4aP56371 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab4aP56371 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab4aP56371 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab4aP56371 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab4aP56371 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab4aP56371 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab4aP56371 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab4aP56371 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab4aP56371 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab4aP56371 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab4aP56371 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab4aP56371 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab4aP56371 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab4aP56371 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab4aP56371 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab4aP56371 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab4aP56371 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab4aP56371 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab4aP56371 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab4aP56371 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab4aP56371 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab4aP56371 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab4aP56371 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab4aP56371 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab4aP56371 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab4aP56371 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms