Protein–RNA interactions for Protein: P55735

SEC13, Protein SEC13 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC13P55735 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEC13P55735 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEC13P55735 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEC13P55735 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEC13P55735 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEC13P55735 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEC13P55735 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEC13P55735 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEC13P55735 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEC13P55735 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEC13P55735 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEC13P55735 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEC13P55735 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SEC13P55735 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEC13P55735 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEC13P55735 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEC13P55735 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEC13P55735 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEC13P55735 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEC13P55735 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEC13P55735 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEC13P55735 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SEC13P55735 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEC13P55735 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEC13P55735 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEC13P55735 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEC13P55735 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEC13P55735 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEC13P55735 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEC13P55735 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEC13P55735 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEC13P55735 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEC13P55735 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEC13P55735 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEC13P55735 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEC13P55735 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEC13P55735 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEC13P55735 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEC13P55735 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEC13P55735 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEC13P55735 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEC13P55735 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEC13P55735 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEC13P55735 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEC13P55735 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEC13P55735 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEC13P55735 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SEC13P55735 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEC13P55735 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEC13P55735 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEC13P55735 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEC13P55735 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEC13P55735 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEC13P55735 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEC13P55735 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEC13P55735 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEC13P55735 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEC13P55735 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEC13P55735 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEC13P55735 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEC13P55735 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEC13P55735 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEC13P55735 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEC13P55735 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEC13P55735 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEC13P55735 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEC13P55735 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEC13P55735 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEC13P55735 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEC13P55735 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEC13P55735 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEC13P55735 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC13P55735 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC13P55735 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC13P55735 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC13P55735 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC13P55735 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC13P55735 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC13P55735 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC13P55735 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC13P55735 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC13P55735 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC13P55735 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SEC13P55735 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEC13P55735 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEC13P55735 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEC13P55735 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEC13P55735 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEC13P55735 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEC13P55735 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEC13P55735 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEC13P55735 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEC13P55735 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEC13P55735 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEC13P55735 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEC13P55735 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEC13P55735 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEC13P55735 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEC13P55735 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEC13P55735 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms