Protein–RNA interactions for Protein: P54987

Acod1, Cis-aconitate decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acod1P54987 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Acod1P54987 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Acod1P54987 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Acod1P54987 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Acod1P54987 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Acod1P54987 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Acod1P54987 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Acod1P54987 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Acod1P54987 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Acod1P54987 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Acod1P54987 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Acod1P54987 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Acod1P54987 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Acod1P54987 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Acod1P54987 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Acod1P54987 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Acod1P54987 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Acod1P54987 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Acod1P54987 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Acod1P54987 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Acod1P54987 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Acod1P54987 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Acod1P54987 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Acod1P54987 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Acod1P54987 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Acod1P54987 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Acod1P54987 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Acod1P54987 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Acod1P54987 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Acod1P54987 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Acod1P54987 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Acod1P54987 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Acod1P54987 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Acod1P54987 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Acod1P54987 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Acod1P54987 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Acod1P54987 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Acod1P54987 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Acod1P54987 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Acod1P54987 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Acod1P54987 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Acod1P54987 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Acod1P54987 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Acod1P54987 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Acod1P54987 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Acod1P54987 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Acod1P54987 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Acod1P54987 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Acod1P54987 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Acod1P54987 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Acod1P54987 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Acod1P54987 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Acod1P54987 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Acod1P54987 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Acod1P54987 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Acod1P54987 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Acod1P54987 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Acod1P54987 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Acod1P54987 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Acod1P54987 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Acod1P54987 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Acod1P54987 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Acod1P54987 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Acod1P54987 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Acod1P54987 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Acod1P54987 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Acod1P54987 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Acod1P54987 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Acod1P54987 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Acod1P54987 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Acod1P54987 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Acod1P54987 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Acod1P54987 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Acod1P54987 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Acod1P54987 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Acod1P54987 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Acod1P54987 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Acod1P54987 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Acod1P54987 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Acod1P54987 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Acod1P54987 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Acod1P54987 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Acod1P54987 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Acod1P54987 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Acod1P54987 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Acod1P54987 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Acod1P54987 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Acod1P54987 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Acod1P54987 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Acod1P54987 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Acod1P54987 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Acod1P54987 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Acod1P54987 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Acod1P54987 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Acod1P54987 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Acod1P54987 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Acod1P54987 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Acod1P54987 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Acod1P54987 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Acod1P54987 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms