Protein–RNA interactions for Protein: P52793

Efna1, Ephrin-A1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna1P52793 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Efna1P52793 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Efna1P52793 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Efna1P52793 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Efna1P52793 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Efna1P52793 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Efna1P52793 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Efna1P52793 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Efna1P52793 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Efna1P52793 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Efna1P52793 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Efna1P52793 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Efna1P52793 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Efna1P52793 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Efna1P52793 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Efna1P52793 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Efna1P52793 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Efna1P52793 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Efna1P52793 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Efna1P52793 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Efna1P52793 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Efna1P52793 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Efna1P52793 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Efna1P52793 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Efna1P52793 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Efna1P52793 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Efna1P52793 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Efna1P52793 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Efna1P52793 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Efna1P52793 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Efna1P52793 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Efna1P52793 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Efna1P52793 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Efna1P52793 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Efna1P52793 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Efna1P52793 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Efna1P52793 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Efna1P52793 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Efna1P52793 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Efna1P52793 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Efna1P52793 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Efna1P52793 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Efna1P52793 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Efna1P52793 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Efna1P52793 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Efna1P52793 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Efna1P52793 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Efna1P52793 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Efna1P52793 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Efna1P52793 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Efna1P52793 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Efna1P52793 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Efna1P52793 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Efna1P52793 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Efna1P52793 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Efna1P52793 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Efna1P52793 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Efna1P52793 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Efna1P52793 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Efna1P52793 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Efna1P52793 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Efna1P52793 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Efna1P52793 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Efna1P52793 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Efna1P52793 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Efna1P52793 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Efna1P52793 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Efna1P52793 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Efna1P52793 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Efna1P52793 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Efna1P52793 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Efna1P52793 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Efna1P52793 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Efna1P52793 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Efna1P52793 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Efna1P52793 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Efna1P52793 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Efna1P52793 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Efna1P52793 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Efna1P52793 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Efna1P52793 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Efna1P52793 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Efna1P52793 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Efna1P52793 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Efna1P52793 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Efna1P52793 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Efna1P52793 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Efna1P52793 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Efna1P52793 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Efna1P52793 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Efna1P52793 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Efna1P52793 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Efna1P52793 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Efna1P52793 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Efna1P52793 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Efna1P52793 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Efna1P52793 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Efna1P52793 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Efna1P52793 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Efna1P52793 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms