Protein–RNA interactions for Protein: P50283

Cd7, T-cell antigen CD7, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd7P50283 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd7P50283 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd7P50283 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd7P50283 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd7P50283 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd7P50283 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd7P50283 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd7P50283 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd7P50283 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd7P50283 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd7P50283 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd7P50283 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd7P50283 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd7P50283 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd7P50283 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd7P50283 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd7P50283 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd7P50283 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd7P50283 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd7P50283 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd7P50283 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd7P50283 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd7P50283 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd7P50283 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd7P50283 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd7P50283 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd7P50283 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd7P50283 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd7P50283 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd7P50283 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd7P50283 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd7P50283 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd7P50283 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd7P50283 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd7P50283 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd7P50283 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd7P50283 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd7P50283 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd7P50283 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd7P50283 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd7P50283 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd7P50283 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd7P50283 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd7P50283 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd7P50283 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd7P50283 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd7P50283 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd7P50283 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd7P50283 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd7P50283 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd7P50283 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd7P50283 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd7P50283 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd7P50283 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd7P50283 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cd7P50283 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cd7P50283 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cd7P50283 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cd7P50283 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd7P50283 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd7P50283 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd7P50283 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd7P50283 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd7P50283 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd7P50283 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd7P50283 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd7P50283 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd7P50283 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd7P50283 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd7P50283 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd7P50283 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd7P50283 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd7P50283 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cd7P50283 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd7P50283 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd7P50283 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd7P50283 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd7P50283 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd7P50283 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd7P50283 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd7P50283 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd7P50283 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd7P50283 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd7P50283 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd7P50283 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd7P50283 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd7P50283 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd7P50283 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd7P50283 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd7P50283 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd7P50283 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd7P50283 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd7P50283 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd7P50283 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd7P50283 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd7P50283 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd7P50283 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd7P50283 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd7P50283 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd7P50283 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms