Protein–RNA interactions for Protein: P48985

Atoh1, Protein atonal homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh1P48985 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atoh1P48985 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atoh1P48985 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atoh1P48985 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atoh1P48985 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atoh1P48985 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atoh1P48985 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atoh1P48985 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atoh1P48985 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Atoh1P48985 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atoh1P48985 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atoh1P48985 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atoh1P48985 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Atoh1P48985 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Atoh1P48985 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Atoh1P48985 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atoh1P48985 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atoh1P48985 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atoh1P48985 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atoh1P48985 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atoh1P48985 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atoh1P48985 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Atoh1P48985 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Atoh1P48985 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atoh1P48985 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atoh1P48985 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atoh1P48985 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atoh1P48985 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atoh1P48985 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atoh1P48985 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atoh1P48985 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atoh1P48985 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atoh1P48985 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Atoh1P48985 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atoh1P48985 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atoh1P48985 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atoh1P48985 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atoh1P48985 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atoh1P48985 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atoh1P48985 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atoh1P48985 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atoh1P48985 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atoh1P48985 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Atoh1P48985 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atoh1P48985 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atoh1P48985 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atoh1P48985 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atoh1P48985 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atoh1P48985 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atoh1P48985 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atoh1P48985 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atoh1P48985 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atoh1P48985 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atoh1P48985 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atoh1P48985 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Atoh1P48985 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atoh1P48985 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atoh1P48985 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atoh1P48985 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atoh1P48985 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atoh1P48985 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atoh1P48985 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atoh1P48985 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atoh1P48985 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atoh1P48985 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Atoh1P48985 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atoh1P48985 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atoh1P48985 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atoh1P48985 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atoh1P48985 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atoh1P48985 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atoh1P48985 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atoh1P48985 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atoh1P48985 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atoh1P48985 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atoh1P48985 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atoh1P48985 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Atoh1P48985 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atoh1P48985 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atoh1P48985 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atoh1P48985 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atoh1P48985 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atoh1P48985 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atoh1P48985 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atoh1P48985 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atoh1P48985 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Atoh1P48985 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atoh1P48985 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atoh1P48985 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atoh1P48985 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atoh1P48985 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atoh1P48985 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atoh1P48985 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atoh1P48985 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atoh1P48985 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Atoh1P48985 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atoh1P48985 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atoh1P48985 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atoh1P48985 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atoh1P48985 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms