Protein–RNA interactions for Protein: P15116

Cdh2, Cadherin-2, mousemouse

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh2P15116 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdh2P15116 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdh2P15116 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdh2P15116 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdh2P15116 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdh2P15116 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdh2P15116 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdh2P15116 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdh2P15116 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdh2P15116 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdh2P15116 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdh2P15116 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdh2P15116 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdh2P15116 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdh2P15116 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdh2P15116 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdh2P15116 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdh2P15116 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdh2P15116 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdh2P15116 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdh2P15116 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdh2P15116 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdh2P15116 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdh2P15116 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdh2P15116 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdh2P15116 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdh2P15116 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdh2P15116 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdh2P15116 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdh2P15116 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdh2P15116 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdh2P15116 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdh2P15116 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdh2P15116 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdh2P15116 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdh2P15116 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdh2P15116 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdh2P15116 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdh2P15116 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdh2P15116 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdh2P15116 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Cdh2P15116 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdh2P15116 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdh2P15116 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdh2P15116 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdh2P15116 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdh2P15116 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdh2P15116 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdh2P15116 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdh2P15116 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdh2P15116 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdh2P15116 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdh2P15116 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdh2P15116 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdh2P15116 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdh2P15116 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdh2P15116 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdh2P15116 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdh2P15116 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdh2P15116 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdh2P15116 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdh2P15116 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdh2P15116 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdh2P15116 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdh2P15116 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdh2P15116 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdh2P15116 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdh2P15116 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdh2P15116 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdh2P15116 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdh2P15116 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdh2P15116 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdh2P15116 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdh2P15116 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdh2P15116 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdh2P15116 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdh2P15116 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdh2P15116 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdh2P15116 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdh2P15116 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdh2P15116 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdh2P15116 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdh2P15116 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdh2P15116 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdh2P15116 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdh2P15116 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdh2P15116 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdh2P15116 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdh2P15116 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdh2P15116 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdh2P15116 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdh2P15116 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdh2P15116 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdh2P15116 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdh2P15116 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdh2P15116 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdh2P15116 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdh2P15116 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdh2P15116 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdh2P15116 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms