Protein–RNA interactions for Protein: P11087

Col1a1, Collagen alpha-1(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a1P11087 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col1a1P11087 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col1a1P11087 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col1a1P11087 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col1a1P11087 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col1a1P11087 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col1a1P11087 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col1a1P11087 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col1a1P11087 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col1a1P11087 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col1a1P11087 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col1a1P11087 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col1a1P11087 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col1a1P11087 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col1a1P11087 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col1a1P11087 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col1a1P11087 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col1a1P11087 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Col1a1P11087 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Col1a1P11087 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Col1a1P11087 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Col1a1P11087 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Col1a1P11087 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Col1a1P11087 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Col1a1P11087 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Col1a1P11087 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Col1a1P11087 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Col1a1P11087 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Col1a1P11087 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Col1a1P11087 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Col1a1P11087 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Col1a1P11087 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Col1a1P11087 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Col1a1P11087 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col1a1P11087 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Col1a1P11087 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col1a1P11087 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col1a1P11087 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col1a1P11087 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col1a1P11087 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col1a1P11087 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Col1a1P11087 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col1a1P11087 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col1a1P11087 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col1a1P11087 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col1a1P11087 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col1a1P11087 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col1a1P11087 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col1a1P11087 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col1a1P11087 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col1a1P11087 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col1a1P11087 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col1a1P11087 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col1a1P11087 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col1a1P11087 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col1a1P11087 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col1a1P11087 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Col1a1P11087 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col1a1P11087 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col1a1P11087 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col1a1P11087 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col1a1P11087 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col1a1P11087 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col1a1P11087 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col1a1P11087 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col1a1P11087 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col1a1P11087 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col1a1P11087 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col1a1P11087 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col1a1P11087 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col1a1P11087 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col1a1P11087 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col1a1P11087 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Col1a1P11087 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Col1a1P11087 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Col1a1P11087 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Col1a1P11087 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Col1a1P11087 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Col1a1P11087 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Col1a1P11087 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Col1a1P11087 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Col1a1P11087 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Col1a1P11087 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Col1a1P11087 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Col1a1P11087 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Col1a1P11087 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Col1a1P11087 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Col1a1P11087 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Col1a1P11087 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Col1a1P11087 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Col1a1P11087 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Col1a1P11087 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Col1a1P11087 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Col1a1P11087 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Col1a1P11087 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Col1a1P11087 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col1a1P11087 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col1a1P11087 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col1a1P11087 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col1a1P11087 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms