Protein–RNA interactions for Protein: P09022

Hoxa1, Homeobox protein Hox-A1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa1P09022 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa1P09022 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa1P09022 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa1P09022 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa1P09022 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa1P09022 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa1P09022 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa1P09022 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa1P09022 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa1P09022 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa1P09022 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa1P09022 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa1P09022 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa1P09022 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa1P09022 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa1P09022 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa1P09022 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa1P09022 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa1P09022 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa1P09022 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa1P09022 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa1P09022 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa1P09022 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa1P09022 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa1P09022 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa1P09022 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa1P09022 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa1P09022 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa1P09022 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa1P09022 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa1P09022 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa1P09022 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa1P09022 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa1P09022 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa1P09022 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa1P09022 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa1P09022 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa1P09022 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa1P09022 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa1P09022 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa1P09022 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa1P09022 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa1P09022 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa1P09022 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa1P09022 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxa1P09022 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxa1P09022 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxa1P09022 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxa1P09022 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxa1P09022 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxa1P09022 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxa1P09022 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxa1P09022 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxa1P09022 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxa1P09022 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa1P09022 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa1P09022 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa1P09022 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa1P09022 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa1P09022 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa1P09022 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa1P09022 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa1P09022 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa1P09022 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa1P09022 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa1P09022 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa1P09022 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa1P09022 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa1P09022 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa1P09022 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa1P09022 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa1P09022 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa1P09022 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa1P09022 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa1P09022 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa1P09022 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa1P09022 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa1P09022 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa1P09022 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa1P09022 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa1P09022 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa1P09022 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa1P09022 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa1P09022 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa1P09022 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa1P09022 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa1P09022 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa1P09022 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa1P09022 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa1P09022 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa1P09022 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa1P09022 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa1P09022 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa1P09022 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa1P09022 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa1P09022 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa1P09022 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa1P09022 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa1P09022 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa1P09022 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms